El análisis de la composición mineralógica global de los sedimentos Lago-Mare y del Zancliense inferior de la cuenca de Málaga muestra diferencias significativas hacia la mitad de la secuencia del Zancliense inferior. Este cambio consiste en un aumento de dolomita, un descenso de filosilicatos y la desaparición del yeso, lo que puede relacionarse con una mayor profundización de la cuenca y un aumento en los aportes procedentes de la erosión de las dolomías maláguides en el área fuente. Por el contrario, el estudio de los minerales de la arcilla muestra un cambio sustancial en el límite Mioceno-Plioceno, apreciándose un aumento considerable en esmectita, un descenso en illita y caolinita, y la práctica desaparición de clorita. Este hecho podría relacionarse con un cambio en las condiciones climáticas, pasando de un clima húmedo y cálido a uno más seco, sin mencionar la posible influencia de la tectónica