Il y a un appel croissant pour des inventaires qui évaluent les modèles géographiques dans la diversité des ressources phytogénétiques maintenues à la ferme et dans les populations naturelles des espèces afin d'améliorer leur utilisation et leur conservation. De telles évaluations sont pertinentes pour les espèces d'arbres tropicaux et subtropicaux utiles, car beaucoup de ces espèces sont encore non domestiquées, ou à un stade embryonnaire de domestication et les populations locales peuvent offrir des traits encore inconnus de grande valeur pour une domestication plus poussée. Pour de nombreuses espèces de croisement, comme la plupart des arbres, la dépression de consanguinité peut être un problème, et la diversité génétique est importante pour soutenir la production locale. La diversité est également cruciale pour que les espèces s'adaptent aux changements environnementaux. Cet article explore les possibilités d'incorporer des données de marqueurs moléculaires dans les systèmes d'information géographique (SIG) pour permettre la visualisation et une meilleure compréhension des modèles spatiaux de la diversité génétique en tant qu'intrant clé pour optimiser la conservation et l'utilisation des ressources phytogénétiques, sur la base d'une étude de cas de cherimoya (Annona cherimola Mill.), une espèce d'arbre fruitier néotropical. Nous présentons des analyses spatiales pour (1) améliorer la compréhension de la distribution spatiale de la diversité génétique des peuplements naturels et des arbres cultivés de cherimoya en Équateur, en Bolivie et au Pérou sur la base de marqueurs moléculaires microsatellites (SSR) ; et (2) formuler des stratégies de conservation optimales en révélant les zones prioritaires pour la conservation in situ et en identifiant les lacunes existantes en matière de diversité dans les collections ex situ. Nous avons trouvé des niveaux élevés de richesse allélique, des allèles localement communs et une hétérozygotie attendue dans le centre d'origine putatif de cherimoya, le sud de l'Équateur et le nord du Pérou, tandis que les niveaux de diversité dans le sud du Pérou et en particulier en Bolivie étaient significativement plus faibles. L'application du SIG sur un grand ensemble de données microsatellites permet une priorisation plus détaillée des zones de conservation in situ et de collecte ciblée dans la gamme de distribution andine des chérimoya que les études précédentes, c'est-à-dire au niveau des provinces et des départements en Équateur et au Pérou, respectivement.

Existe una creciente demanda de inventarios que evalúen los patrones geográficos en la diversidad de los recursos fitogenéticos mantenidos en la granja y en las poblaciones naturales de las especies con el fin de mejorar su uso y conservación. Tales evaluaciones son relevantes para especies de árboles tropicales y subtropicales útiles, ya que muchas de estas especies aún no están domesticadas, o en etapas incipientes de domesticación y las poblaciones locales pueden ofrecer rasgos aún desconocidos de alto valor para una mayor domesticación. Para muchas especies que se cruzan, como la mayoría de los árboles, la depresión por endogamia puede ser un problema, y la diversidad genética es importante para mantener la producción local. La diversidad también es crucial para que las especies se adapten a los cambios ambientales. Este documento explora las posibilidades de incorporar datos de marcadores moleculares en los Sistemas de Información Geográfica (SIG) para permitir la visualización y una mejor comprensión de los patrones espaciales de la diversidad genética como un insumo clave para optimizar la conservación y el uso de los recursos fitogenéticos, basado en un estudio de caso de la chirimoya (Annona chirimola Mill.), una especie de árbol frutal neotropical. Presentamos análisis espaciales para (1) mejorar la comprensión de la distribución espacial de la diversidad genética de los rodales naturales de chirimoya y los árboles cultivados en Ecuador, Bolivia y Perú basados en marcadores moleculares de microsatélites (SSR); y (2) formular estrategias de conservación óptimas al revelar áreas prioritarias para la conservación in situ e identificar las brechas de diversidad existentes en las colecciones ex situ. Encontramos altos niveles de riqueza alélica, alelos localmente comunes y heterocigosidad esperada en el supuesto centro de origen de la chirimoya, el sur de Ecuador y el norte de Perú, mientras que los niveles de diversidad en el sur de Perú y especialmente en Bolivia fueron significativamente más bajos. La aplicación de SIG en un gran conjunto de datos de microsatélites permite una priorización más detallada de las áreas para la conservación in situ y la recolección específica en todo el rango de distribución andina de chirimoya que los estudios anteriores, es decir, a nivel de provincia y departamento en Ecuador y Perú, respectivamente.

There is a growing call for inventories that evaluate geographic patterns in diversity of plant genetic resources maintained on farm and in species' natural populations in order to enhance their use and conservation. Such evaluations are relevant for useful tropical and subtropical tree species, as many of these species are still undomesticated, or in incipient stages of domestication and local populations can offer yet-unknown traits of high value to further domestication. For many outcrossing species, such as most trees, inbreeding depression can be an issue, and genetic diversity is important to sustain local production. Diversity is also crucial for species to adapt to environmental changes. This paper explores the possibilities of incorporating molecular marker data into Geographic Information Systems (GIS) to allow visualization and better understanding of spatial patterns of genetic diversity as a key input to optimize conservation and use of plant genetic resources, based on a case study of cherimoya (Annona cherimola Mill.), a Neotropical fruit tree species. We present spatial analyses to (1) improve the understanding of spatial distribution of genetic diversity of cherimoya natural stands and cultivated trees in Ecuador, Bolivia and Peru based on microsatellite molecular markers (SSRs); and (2) formulate optimal conservation strategies by revealing priority areas for in situ conservation, and identifying existing diversity gaps in ex situ collections. We found high levels of allelic richness, locally common alleles and expected heterozygosity in cherimoya's putative centre of origin, southern Ecuador and northern Peru, whereas levels of diversity in southern Peru and especially in Bolivia were significantly lower. The application of GIS on a large microsatellite dataset allows a more detailed prioritization of areas for in situ conservation and targeted collection across the Andean distribution range of cherimoya than previous studies could do, i.e. at province and department level in Ecuador and Peru, respectively.

هناك دعوة متزايدة لقوائم الجرد التي تقيم الأنماط الجغرافية في تنوع الموارد الوراثية النباتية المحفوظة في المزارع وفي التجمعات الطبيعية للأنواع من أجل تعزيز استخدامها وحفظها. هذه التقييمات ذات صلة بأنواع الأشجار الاستوائية وشبه الاستوائية المفيدة، حيث أن العديد من هذه الأنواع لا تزال غير مستأنسة، أو في المراحل الأولى من التدجين ويمكن للسكان المحليين أن يقدموا سمات غير معروفة ذات قيمة عالية لمزيد من التدجين. بالنسبة للعديد من الأنواع المتقاطعة، مثل معظم الأشجار، يمكن أن يكون اكتئاب التزاوج الداخلي مشكلة، والتنوع الوراثي مهم للحفاظ على الإنتاج المحلي. كما أن التنوع أمر بالغ الأهمية للأنواع للتكيف مع التغيرات البيئية. تستكشف هذه الورقة إمكانيات دمج بيانات العلامات الجزيئية في نظم المعلومات الجغرافية (GIS) للسماح بالتصور وفهم أفضل للأنماط المكانية للتنوع الوراثي كمدخل رئيسي لتحسين حفظ واستخدام الموارد الوراثية النباتية، بناءً على دراسة حالة الشيريمويا (مطحنة أنونا شيريمويا)، وهي نوع من أشجار الفاكهة الاستوائية الحديثة. نقدم تحليلات مكانية من أجل (1) تحسين فهم التوزيع المكاني للتنوع الجيني لأكشاك الشيريمويا الطبيعية والأشجار المزروعة في الإكوادور وبوليفيا وبيرو بناءً على العلامات الجزيئية للأقمار الصناعية الدقيقة (SSRs )؛ و (2) صياغة استراتيجيات الحفظ المثلى من خلال الكشف عن المناطق ذات الأولوية للحفظ في الموقع، وتحديد فجوات التنوع الحالية في المجموعات خارج الموقع. وجدنا مستويات عالية من ثراء الأليلات، والأليلات الشائعة محليًا، والزيجوت غير المتجانس المتوقع في مركز المنشأ المفترض لشيريمويا، وجنوب الإكوادور وشمال بيرو، في حين كانت مستويات التنوع في جنوب بيرو وخاصة في بوليفيا أقل بكثير. يسمح تطبيق نظام المعلومات الجغرافية على مجموعة بيانات كبيرة من الأقمار الصناعية الصغيرة بتحديد أولويات أكثر تفصيلاً لمناطق الحفظ في الموقع والتجميع المستهدف عبر نطاق توزيع الأنديز من الشيريمويا أكثر مما يمكن أن تفعله الدراسات السابقة، أي على مستوى المقاطعات والإدارات في الإكوادور وبيرو، على التوالي.