
�� ���������������������� ���������������� ������������������ �������������� ������ ������������������ ������������������, ������ ���� ������������������ �������������� ������������������������ ������������������ ������������������ ���������� ���������� ��������������������. ���������� ���� ������������������ �������������� �������������������� ���� �������������������������� ���������������������������� ������������������������������ ������������, �������������������������������������� ������ ���������������������� ������ ���� ���������������� ������ �������������� ������ �������� ������������������������. �� ������ ������������������ ������ �������������� ������������ ������ ������ ���������������� �������������� ������������ ���������� �� ������������������������������, �������� �������������������������� �� ������������������������������ ������ �������������������� ������������������ ���� �������������� �������������� �������������� ����������������. �������� ���� ������������������ ������������ ��������, ������ ������������������, ���� �������������� ���������������������������� ���������� �������������������� ������������ �������� ������������������ ������ ������������ ���������� ������ �������������������� ��������������, ���� �������������������� �� ����������, �������������� ���� ������ ���������� ������ ���� ����������������, ���� ������������ ���������� ������ ������ 90%. ���������� ������������������, ����������������, �� ���������� ������ ������������������ ������ ������������������ ���������� ������ ����������������, �������� ���� ���������������������� ���� ������������������ ������������ �������������������������� ��������. ���������� �������� ������ �� �������������� ������������ ������ ���������������� ����������������. ���������������� ���������������������������������� 8 ������������������������������, ������ ������������ ������ ���� ������������������ ������ �������� 2012 ������ 2013, ������ 10 ���������������������� �������������������� ������������������������ ������ �������������������������� ������ ������������������ �������������������� ������������ �������� ���� ������������ ������ �������������������������� ������ ������ �������������������������� ��������. ���� ������������������������ ������ ������ ������������������ ������ ���������������������� ������ �������������� ������ ���� �������������������������� ��������, �������������� ������ ���� ������������������ ���������������� ���������� ������ ������������ �������� �� Botrytis spp., ���� �������������� ������������������ 62,2 %. ������������, ���� 32,6 % ������ ���������������������� �������������������������� ������ ������������ ���� 5 ���������������������� �������� Fusarium, ���� F. equiseti, F. oxysporum, F. proliferatum, F. armeniacum ������ F. avenaceum. ���� ������������ �������������� �������������������� ������������������������ ������ ���� ���������������� Alternaria alternata (1,3 %) ������ Stemphylium sp. (3 %). ����������, ���� �������������� 0,9 % ���������������������� ������ �� Rhizoctonia solani AG4, �� ������������ ���� ������ ������������������ ������������������ ���������������� ������������ ���� �������������� ���������������� ��������������������, ������ ������������������������ ������������������ �������������� ���� �������� ������������ ��������������, �������� ������ ���������������������������� �������������������� �������������������� ������ ������������ Trichoderma ������ �������� ������ ����������. �� ���������������� ������ ������������������ ������������ ������ ������ �������� ������ ���������������������������������� ���� ����������������������������, ������������ ������ ������ ���� ���������� ������������ �� Botrytis spp.���������������������� ���� �������������� ������������ �������������� ������ �������������� ���� 41,6 %, ���� �������������� ������������ ���� �������������� ������ ������������ ���� 86 %, ������ �� �������������� ���������������� ������������ ������ ���� ���������������������� ������ ���������������������� ������������ ������ ���������������������������� ������ ���������������������������������� ������ ������������. ������������, ������ ������������ ������ ����������������������, ���� �������������� ������ �������� �������� ����������, ���� ���� �������� ������ Fusarium ���� �������������������� ������ ���� ���������������� ���������������� ���� ������������������������ ���� ���� ���������������� ���������������� ���� ������������ ���������������� ������������, ���� ���������� ���� ������ Botrytis. ��������, ������ ���� ������������������ ������������������ �������������������� ������������ ������ ���� �������� Fusarium ������ ������������������������, ���������������������� ���� ���������������� ������������������ ���������� ���������������������������� ����������������, ������ �������� ���������������������� �������� �������� ���������� �������������� ������������ �������� �������������� �� ���������������� ����������������������, ���� ���������������� ���� �������� ������������ ��������������, �������� ������������ ������ ������ ���������������� ������������������ ���� �������������� ��������������������, ������������������������ �������������������� ���� ���������� (A. alternata, Stemphylium sp. ������ Botrytis cinerea), ���������������� (B. cinerea sensu stricto) ������ �������� (R. solani).������������ ������ ���������������� ������������������ ������ ���������������� �������� ���� ���������������������� �� �������� ������ ������������������ ������ �� �������������������������� ������ ���������������� ���� ����������������������, ������ �������������������� ������������������ ������������, �������� ���������������� ������ ���� ���������� ������������ ������ ��������������, ������ Botrytis spp.�� �������������������������� ������ ���������������������� ���������� �������������� ���� ���� ���������������� ������ ������������������ ������������������ Boty ������ Flipper, ������ ������ ������������������ ������ ������������������ ������ ������������������ 21 bp ������ 18 bp ������ �������������� ������ ������������������������ ������������������ mrr, ������ ���� �������������������� ������ Botrytiscinereasensustricto ������ ������ ������ ���������� �������� ������ ���������������� ������ Botrytis, ������ BotrytisGroupS�������� ������ ������ B. pseudocinerea. ���� ������������������������ �������������� ������ ���������������� �������� ���� �������������� ���������� transposa ���� �������������� 83,6%, ���� ���������� ������������ ������ ������������������ �������� ������ ���� ������ ���������������� ����������������, ������ �������������� ���������� Boty, Flipper �� Vacuma ������������������������ ���� �������������� 11.9, 1.5 ������ 3%, ��������������������. ������ ���������� ���� �������������� B. cinereasensustricto, ������������������������ ���� �������������� 69.7%, ������ ���� ������������������ ������������ �������������� (29.6%) ���������������� ������ �������������� BotrytisGroupS. ������������, ������ ���������� �������� �������� ������������, ���������������������� 1 ���������������� ������ B. pseudocinerea.���� ������ ���������� ������ �������������������������� ������ ���������������� ������ ��������������������������, �������� ������������������ ������������ ���� ������������������ ����������������������. ���������� �������������� ������������������������ ���������� �������������������������� ������ ������������������ III ������ ���������������� (89.8%), �������� �������������������������� ������ �������������������������� ������ �������������������� ���������� (73%) ������ ���� ������������������������������ ���������������������� (64.6%), ������ ���� �������������������� �������������� ���������������� �������������� ���� �������������������������� �������� ������������������������������������, ���� ����������������������������, ���� ������������������������������ ������ ���� ������������������������������. ������������, �������������������� �� ���������������� ���������������������� ������ �������������� sdhB, ���� ������������ �������������������� �������������������������� ������ ���������������������� ������ ������������ ������ SDHIs, ������ �������������� ������ ������ 89,8 % ������ �������������������� ���������������� ���� ���������������������� ������ ���� ������ ������ ���������������������� ���������� ������ ������������, ������������ ���� ������������������ H272R. ������������, ���� 6,3 % ������ ���������������������� �������� ���� ������������������ ��230��, ������ ������ ���������� �������� ��������������������, ���������������������� ������ ������ ������������������, ������ �������������� ���������������� ���� ������������������������ ���� �������������������������� ������ ������ boscalid ������ ������ fluopyram, �������� ���������������������������� �� �������������� ������ ���������������� ������ ������������������ 225 (P225H).������������ �������������� ���������������� (6.7%) ������ ������������������ �������������������������� ���� ������ ���� ����������������������, ������������������������������ ���� MDR1h, ���������� ���������������������� �� �������������� 3 ��.��. ������ ���� �������������� mrr1, ������ �������� ���������� �� ���������� ������������������ �������� �������� ������������.
Arboriculture is an important part of agriculture production. ��specially, modern farming methods generate substantial profits for the producers. These modern methods require the use of certified propagating material, and more specifically the use of rootstocks that could meet the needs of each occasion. The most contemporary and secure way to produce such a quality propagating material is tissue culture. This multiplication method ensure a high number of rootstocks with the desirable genotype, at short time intervals. However, at the final stage of production, nurseries often face significant damages due to fungal pathogens that cause damping off diseases, and in some cases, losses can reach 90 %. Thus, it is important to identify these pathogens that cause damping off diseases in rootstock seedlings, in order to apply the suitable control strategy.The primary aim of current study was the creation of a database with the causal agents of damping off diseases in micropropagated stone- and pomefruit rootstock seedlings. In total, 248 isolates were collected during 2012 and 2013 from 10 different rootstock seedlings. Results showed that, Botrytis spp. was the major pathogen with an incidence of 62,2 %. Also, 32,6 % of the isolates were identified as five different species of Fusarium, while Alternaria alternata (1,3 %) and Stemphylium sp. (3%) were isolated in low rates. Although, Rhizoctonia solani AG4 is considered to be an important pathogen of damping off diseases in many crops worldwide, in that case was detected in very low frequencies (0,9 %), because of the use of the biological agent Trichoderma used for the control of soilborne pathogens. The pathogen ditribution between the two sampling years showed that, while in 2012 Botrytis was detected in low rates (41,6 %) compared with Fusarium spp. (48,3 %), in 2013 the frequency reached a value of 86 %. The seasonal distribution showed that Botrytis was isolated mainly in Spring samplings. Among the different rootstock, the rates of Botrytis were very high in most cases, while in several hosts, Fusarium seemed to be the predominant pathogen, but with minor differences compared to Botrytis. The artificial inoculations revealed the inability of Fusarium species to infect rootstock seedlings, if these hosts have not undergone any biotic or abiotc stress, previously. In contrast, inoculation in various hosts with the remainings isolated fungi had resulted in the appearance of symptoms on leaves (A. alternata, Stemphylium sp. and Botrytis cinerea) and root (R. solani).The second part of this research was contucted to investigate the population structure and the resistance profile of Botrytis spp., that originated from the first part.The population structure was investigated on 134 isolates, using two molecular markers, the presence of two transposable elements (TAs, Boty and Flipper) and the presence of a 21bp insertion in the mrr1 gene, encoding a transcription factor, that distincts B.cinerea sensu stricto, from Botrytis Group S, a novel clade within Botrytis populations. Results showed that transposa isolates (both TAs present) were predominant (83.6%), while Boty, Flipper or Vacuma (both TAs absent) isolates were found at frequencies of 11.9, 1.5 and 3%, respectively. Similarly, was found that B. cinerea sensu stricto was predominant in the population (69.7%). However a significant proportion of the isolates were identified as Botrytis group S (29.6%), while 1 isolate was identified as B. pseudocinerea, constituting the first report of this pathogen in Greece.Measurements of fungicide sensitivity revealed the presence of high frequencies of multiple resistance to more than 2 different fungicide classes, mostly associated with target site mutations. Higher frequencies of resistance were observed for QoIs, SDHIs and benzimidazoles with values of 89.8, 73 and 64.6%, respectively, while frequencies of resistance to anilinopyrimidines, hydroxyanilides, dicarboximides and phenylpyrroles were lower. Furthermore, mutations in the sdhB gene which is associated with resistance to SDHIs, were determined. Results showed three different amino acids substitutions in the SdhB subunit. The substitution of histidine to arginine at codon 272 (H272R) was the predominant mutation in a population of isolates which were resistant to boscalid. Moreover, 6,3 % of isolates had the N230I mutation, while for first time worldwide,the substitution of proline to histidine at codon 225 was detected. This is a novel mutation which is associated with resistance both to boscalid and fluopyram. A small proportion of the population (6.7%) was resistant to all fungicide classes. This type of resistance was found to be associated with a 3bp deletion mutation in the gene encoding the mrr1 transcription factor. Isolates with this mutation called MDR1h, and showed high rates of resistance to anilinopyrimidines and phenylpyrrole botryticides. This was the first report of this type of resistant isolates in Greece.
Botrytis cinerea, ������������ ����������������, Seedlings, ��������������������, Damping-off disease
Botrytis cinerea, ������������ ����������������, Seedlings, ��������������������, Damping-off disease
| selected citations These citations are derived from selected sources. This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | 0 | |
| popularity This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network. | Average | |
| influence This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | Average | |
| impulse This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network. | Average |
