Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
addClaim

This Research product is the result of merged Research products in OpenAIRE.

You have already added 0 works in your ORCID record related to the merged Research product.

Онлайн-сервис ИИ-деконволюции и денойзинга для ÐºÐ¾Ð½Ñ„Ð¾ÐºÐ°Ð»ÑŒÐ½Ñ‹Ñ Ð¼Ð¸ÐºÑ€Ð¾ÑÐºÐ¾Ð¿Ð¾Ð²

выпускная квалификационная работа бакалавра

Онлайн-сервис ИИ-деконволюции и денойзинга для ÐºÐ¾Ð½Ñ„Ð¾ÐºÐ°Ð»ÑŒÐ½Ñ‹Ñ Ð¼Ð¸ÐºÑ€Ð¾ÑÐºÐ¾Ð¿Ð¾Ð²

Abstract

Данная работа посвящена разработке онлайн-сервиса, производящего различные процессы улучшения качества трёхмерных изображений люминисцентных объектов малого размера, регистрируемых конфокальными микроскопами. В рамках данного исследования были сформулированы следующие задачи: 1. Изучение существующих алгоритмов, решающих схожие задачи. 2. Разработка алгоритма машинного обучения для автоматической сегментации флуоресцентных сфер. 3. Разработка алгоритма глубокого обучения денойзинга (шумоподавления) для трёхмерных изображений. 4. Создание онлайн-сервиса, обеспечивающего взаимодействие с реализованными алгоритмами. В результате проделанной работы был разработан онлайн-сервис, включающий в себя следующий функционал: 1. Ручной и автоматический подходы к сегментации флуоресцентных сфер. Автоматический подход базировался на методах компьютерного зрения. 2. Алгоритм глубокого обучения для денойзинга трёхмерных изображений, основанный на сети Noise2Noise (N2N) и фильтре Non-local means (NLM), обучен и протестирован на данных из разных микроскопов. 3. Реализованный метод деконволюции Ричарсдона-Люси для генерация эксперментальной функции рассеяния точки (эФРТ) и улучшения трёхмерных изображений. По итогам работы сделан вывод, что онлайн-сервис эффективен для получения более точных изображений клеточных структур и материалов, что позволяет детально анализировать наблюдаемые объекты в медико-биологических исследованиях.

This work is devoted to the development of an online service that produces various processes to improve the quality of three-dimensional images of small-sized luminescent objects recorded by confocal microscopes. The following objectives were formulated as part of this research: 1. Study of existing algorithms that solve similar problems. 2. Development of a machine learning algorithm for automatic segmentation of fluorescent spheres. 3. Development of a deep learning denoising (noise reduction) algorithm for three-dimensional images. 4. Creation of an online service that provides interaction with the implemented algorithms. As a result of this work, an online service was developed that includes the following functionality: 1. Manual and automatic approaches to fluorescent sphere segmentation. The automatic approach was based on computer vision methods. 2. A deep learning algorithm for denoising 3D images based on Noise2Noise (N2N) network and Non-local means (NLM) filter is trained and tested on data from different microscopes. 3. Implemented Richardsdon-Lucy deconvolution method to generate expert point scattering function (ePRF) and improve 3D images. It is concluded that the online service is effective in obtaining more accurate images of cellular structures and materials, which allows detailed analysis of observed objects in biomedical research.

Keywords

денойзинг, свёрточные нейронные сети, флуоресцентная микроскопия, компьютерное зрение, segmentation, конфокальная микроскопия, network architecture, confocal microscopy, fluorescence microscopy, computer vision, онлайн-сервис, online service, сегментация, convolutional neural networks, denoising, Ð°Ñ€Ñ Ð¸Ñ‚ÐµÐºÑ‚ÑƒÑ€Ð° сети

  • BIP!
    Impact byBIP!
    citations
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    0
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Average
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
citations
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
0
Average
Average
Average
Upload OA version
Are you the author? Do you have the OA version of this publication?