La cellule constitue l'unité de base de la vie. Pourtant les plus simples d'entre elles, les bactéries, possèdent une structure d'une extrême complexité et sont capables de comportements sophistiqués. Les cellules eucaryotes sont encore plus complexes. De plus, comparées aux cellules procaryotes, elles présentent une diversification fantastique au niveau morphologique et au niveau de l'organisation qu'elles adoptent : cellules isolées, coloniales ou intégrées et différenciées dans un organisme pluricellulaire. Une question se pose : comment sont apparues les premières cellules eucaryotes ? Une chose certaine est qu'elles n'ont pu apparaître qu'à partir de précurseurs simples. Nous n’aborderons pas dans ce livre en profondeur la question de savoir comment ces précurseurs simples sont apparus. Nous aborderons plus spécifiquement le problème de comprendre comment la cellule eucaryote moderne a pu apparaître à partir de cellules plus simples et quels précurseurs peut-on envisager.La cellule eucaryote, une fois apparue, a connu un grand succès au cours de l’évolution et s’est diversifiée dans une myriade d’organismes ayant des tailles similaires à celle des cellules bactériennes (1-2 μm) jusqu’à des organismes aussi massifs que les baleines, les séquoias géants ou les armillaires, champignons communs dont les mycéliums peuvent peser jusqu’à 2 000 tonnes ! Très souvent, la biodiversité présentée dans les cours ou manuels de biologie se résume à celle des plantes et des animaux. Cependant, ces deux groupes biologiques ne représentent qu'une petite fraction de la diversité biologique des eucaryotes. Celle-ci se voit plus spécialement dans des groupes d'organismes microscopiques ou avec une organisation simple que l'on regroupe sous le terme générique de "Protistes Eucaryotes", qui dans ce livre va prendre une acceptation au sens large, car regroupant tous les organismes qui ne sont clairement ni des animaux (eumétazoaires), ni des plantes supérieures (embryophytes). L’analyse de ces protistes montre que la dichotomie ancienne animal/végétal n’a pas de sens biologique et est progressivement remplacée par une classification plus en adéquation avec ce que l’on sait de l’évolution de la cellule eucaryote. C’est cette classification phylogénétique qui est suivie dans ce livre.Lorsqu’est évoqué le terme de microbe, qui veut dire organisme invisible à l’oeil nu, souvent ce mot est restreint aux bactéries et aux virus (qui ne sont pourtant pas à proprement parlé de vrais organismes vivants, mais c’est un autre débat). Ceux-ci ont pris une telle ampleur dans les cours universitaires que parfois, les microbes eucaryotes ne sont même pas évoqués ! Il existe en effet de nombreux traités de microbiologie dans lesquels, il semblerait que seules les bactéries aient le droit d’apparaître. C’est bien dommage car aussi bien au niveau du fonctionnement de la biosphère que de la santé et des industries humaines, les microbes eucaryotes ont une importance cruciale, parfois bien supérieure à celle des bactéries et des virus. Ce livre propose de corriger cette tendance, en expliquant quelques-unes des caractéristiques des protistes eucaryotes. Le terme microbe n’est en effet pas complètement approprié pour ces organismes dont certains sont bien visible à l’oeil nu...Ce livre prend sa source dans les cours que je professe depuis plus de quinze ans à la maitrise, maintenant le master 1, de Biochimie de l’Université Paris Diderot. J’espère qu’il servira de ressources pour les nombreux collègues qui comme moi enseignent la microbiologie, mais aussi aux étudiants qui dans le futur ne devraient plus ignorer le monde fascinant des protistes.Publics concernés : Etudiants en Master 1 et Master 2 de Microbiologie. Candidats au CAPES et à l’agrégation.