RESUMEN: La distinción propuesta por Ernst Mayr y François Jacob entre biología funcional y biología evolutiva es una clave fundamental para un tratamiento claro y concluyente de dos problemas que, recurrentemente, se colocan en el ámbito de la Filosofía de la Biología: aquel que atañe al posible carácter teleológico de las explicaciones biológicas y aquel relativo a la autonomía de la Biología en relación a la Física y a la Química. Sin sostener una alternativa de solución para ninguno de estos problemas, presentamos esa oposición mostrando su relevancia para el tratamiento de tales cuestiones. Nuestra idea es que las mismas no deberían plantearse sin especificar a cual de los dos dominios de la ciencias de la vida nos estamos refiriendo. Palabras clave: F. Jacob – E. Mayr; biología funcional; biología evolutiva; filosofía de la biología. Functional biology vs. evolutionary biology Abstract: Mayr’s and Jacob’s distinction between functional biology and evolutionary biology is a fundamental key for a clearer and more conclusive treatment of two problems that, currently, are discussed in Philosophy of Biology: that which matter to the teleological character of biological explanations and that which matter to the autonomy of Biology from Physic and Chemistry. Without hold any alternative solution for none of these problems, we present that opposition showing its relevance for the treatment of both questions. Our idea is that these problems shouldn’t be posed without a specification of the domain of Biology that is being considered. Keywords: F. Jacob – E. Mayr; functional biology; evolutionary biology; philosophy of biology