A notoriedade de Quercus suber em Portugal é reforçada, não só pela sua importância económica devido à cortiça, mas também pelas bolotas usadas para alimentação animal. No entanto, pouco se sabe sobre os mecanismos moleculares envolvidos na indução e libertação de dormência que intervêm no crescimento anual da planta, ou sobre as redes genéticas que controlam a separação das flores masculinas e femininas, tanto no tempo como no espaço. O principal objetivo desta tese é obter informações sobre os mecanismos moleculares que regulam o ciclo de dormência dos gomos, a indução de flores, e o desenvolvimento de órgãos masculinos e femininos em Q. suber. Sabe-se que a maioria deste tipo de processos são modulados por fatores epigenéticos. Este trabalho proporcionou a primeira caracterização bioinformática de reguladores epigenéticos em Q. suber e, portanto, pode ser utilizado como plataforma para estudos futuros que abordem o seu envolvimento nesta espécie. A regulação epigenética das transições crescimento-dormência, durante o desenvolvimento dos gomos em Q. suber, foi avaliada através do estudo da expressão de reguladores epigenéticos, e pelos padrões epigenéticos avaliados por imunolocalização. Estes resultados destacam que o ciclo de dormência está sob controlo epigenético. A expressão dos homólogos de genes reguladores de dormência identificados em Q. suber foi analisada por qRT-PCR. Os resultados sugerem que os genes QsSHORT VEGETATIVE PHASE-like (QsSVP-like) foram os candidatos mais prováveis a estarem envolvidos no controlo da dormência dos gomos. Bibliotecas de cDNA de estádios iniciais e tardios do desenvolvimento de flores masculinas e femininas, previamente geradas, foram mapeadas contra o genoma de referência de Q. suber, e a expressão diferencial foi re-avaliada através de uma análise mais precisa. Outros transcriptomas disponíveis de Q. suber (gomos, bolotas, embriões, cortiça e raízes) foram analisados para selecionar genes com expressão especificamente masculina ou feminina. Adicionalmente, os níveis de expressão de homólogos de reguladores de floração foram medidos por qRT-PCR em folhas e gomos. Os resultados sugerem que a indução de flores masculinas é separada temporalmente da indução de flores femininas, e que a determinação da identidade dos órgãos sexuais em flores masculinas ou femininas pode ocorrer pela expressão incorreta do gene de classe B QsPISTILLATA (QsPI). Neste trabalho, a regulação de QsPI foi avaliada através da análise de fragmentos do seu promotor, usando a técnica de yeast one-hybrid. Em suma, o conjunto de resultados obtidos nesta tese ajudou a decifrar as redes genéticas e epigenéticas envolvidas no ciclo dormência dos gomos e no desenvolvimento de flores unisexuais em Q. suber, e poderá complementar estudos futuros em outras árvores com caracteristicas semelhantes.