O conhecimento da prevalência de micro-organismos em uma população animal numa determinada região geográfica é importante para compreensão da distribuição das doenças mais comuns da espécie em estudo e sua importância para saúde pública. Com o crescimento demográfico e o processo de urbanização, houve um estreitamento na relação entre a população humana e os animais domésticos e silvestres, resultando na disseminação de agentes infecciosos e parasitários para novos hospedeiros e ambientes. Logo, o estudo ecoepidemiológico de animais silvestres e sua microbiota são de extrema importância para conhecer, intervir e recomendar ações que visem o controle de zoonoses. Considerando a rica biodiversidade do Brasil, principalmente no que diz respeito à fauna de lagartos, este trabalho teve como objetivo avaliar a riqueza, diversidade e frequência da microbiota fúngica e parasitária de Tropidurus hispidus e analisar seu potencial zoonótico, já que a espécie coexiste com seres humanos, animais domésticos e de produção. A investigação das doenças infecciosas e parasitárias ocorreu no contexto etiológico, ecológico e epidemiológico do meio urbano. Foram realizados exames microbiológicos de swabs de cavidade oral, visando a pesquisa de fungos filamentosos e leveduras, exames coproparasitológicos para pesquisa de enteroparasitas e inspeção visual para pesquisa de ácaros. Os 50 animais foram capturados por meio de coletas ativas manuais utilizando laço de Lutz, em área domiciliar e peridomiciliar do bairro de Sítio dos Pintos, localizado na Região Metropolitana do Recife, Pernambuco, Nordeste do Brasil. Os fungos isolados neste estudo foram Candida spp, Geotrichum sp., Paecilomyces sp., Cladosporium spp., Penicillium sp., Fusarium sp., Alternaria sp., Beauveria sp., Aspergillus spp., Coccidioides sp. e Mycelia strerilia. Constatou-se crescimento fúngico em 100% das amostras analisadas, observando-se maior ocorrência de fungos filamentosos (100%) em relação a leveduras (10%). Em 32% (n=16) das amostras, houve associação entre gêneros e/ou espécies de fungos. Na pesquisa de ectoparasitas, 47 lagartos apresentaram-se infestados, correspondendo a uma prevalência de 94%. Destes, 100% estavam exclusivamente infestados pelo ácaro Eutrombicula alfreddugesi e 2,08% estavam co-infestados por larvas do carrapato Rhipicephalus sanguineus. Quanto aos helmintos e protozoários, constatouse uma prevalência de infecção enteroparasitária de 98% (n=49), que incluiu os lagartos infectados com, no mínimo, um parasita. Houve associação entre dois ou mais gêneros de enteroparasitos, em 87,75% (n=43) dos indíviduos. Foram identificados os nematóides: Parapharyngodon sp., Physalopetara sp. e uma espécie de ascarídeo; e protozoários da família Eimeriidae: Eimeria sp. A frequência de ocorrência dos nematóides foi de: 87,75% (n= 43), 53,06% (n=26) e 46,93% (n=23) para Parapharyngodon sp., Physaloptera sp. e uma espécie de ascarídeo, respectivamente. Os protozoários do gênero Eimeria apresentaram frequência de ocorrência de 87,75% (n=43). A partir desses resultados, conclui-se que existe uma gama muito variada de fungos e parasitas em T. hispidus. Sendo assim, por compartilharem o mesmo ambiente com humanos e animais domésticos, essa espécie de lagarto pode apresentar risco à saúde pública, especialmente para indivíduos imunocomprometidos.