La presente Tesis Doctoral aborda la epidemiología de las parasitosis intestinales en 5 islas de Nicaragua, ubicadas en las regiones Pacífico y Caribe, para identificar especies, prevalencias e intensidades, relacionarlas con factores como edad y sexo, e incorporar diagnóstico molecular buscando especies y subtipos de interés zoonótico. Para ello se emplearon métodos coproparasitológicos tradicionales (Ritchie, Kato-Katz, Ziehl-Neelsen), junto con Mini-FLOTAC y métodos moleculares (PCR y secuenciación Sanger), que permitieron incrementar el espectro y corregir las prevalencias. Se detectó un espectro parasitario conformado por 17 especies, destacando 11 especies de protistas y 4 de helmintos, siendo el porcentaje total de infección de 68,8% (632/918) (61% protistas y 22% helmintos). Como dato curioso, en una de las islas se identificaron, por primera vez en seres humanos de Nicaragua, 2 especies de esporas pertenecientes a los géneros Myxobolus spp. y Henneguya spp. parásitos típicos de peces, sugiriendo próximas investigaciones bajo el enfoque USS. Se detecta una amplia desigualdad de parasitación en ambas regiones, con porcentajes que oscilan entre el 57,6% (Pacífico) hasta el 95,4% (Caribe). En la región Pacífico dominan los protistas, especialmente Blastocystis sp. (llegando hasta 70,5%). En la región Caribe las infecciones por helmintos son altamente prevalentes, predominando Trichuris trichiura (78,8%) y Ascaris lumbricoides (64,7%). El multiparasitismo, presentó la coexistencia de 8 especies en un mismo individuo. Podría considerarse como indicador indirecto de privación social y ambiental. El sexo masculino presentó mayores tasas de infección, los menores de 12-14 años fueron los más afectados, el uso de Mini-FLOTAC permitió determinar la intensidad leve de geohelmintos en la mayoría de islas, si bien, también se hallaron infecciones moderadas y severas por T. trichiura y A. lumbricoides, lo que podría reflejar procesos de reinfección y exposición continua a ambientes insalubres. A nivel molecular, se consiguió identificar 2 muestras con Cryptosporidium hominis y 4 muestras con Entamoeba dispar. Asimismo, se revelaron subtipos de Blastocystis sp. ST1 (64,3%; 9/14), ST2 (75%; 3/4), ST3 (75%; 3/4) y ST7 (100%; 1/1), siendo este último de posible origen zoonótico, y se identificó mayoría de assemblage B (27,3%; 3/11) de Giardia duodenalis, posible transmisión antroponótica. Un 69,9% de los infectados presentaban especies patógenas o potencialmente patógenas (P/PP), siendo la combinación más común Blastocystis sp. + T. trichiura. No se encontró una asociación clara entre consistencia de las heces y parasitación, salvo en el caso de A. lumbricoides, presente en todas las muestras con heces líquidas. La vía fecal-oral fue la principal forma de transmisión en el 94% de los casos. De este trabajo se deduce que la insularidad no reduce cualitativamente el espectro existente en las islas estudiadas y que aparece un predominio de especies protistas, con predominio de Blastocystis sp., quizás demostrando un éxito parcial en las campañas antihelmínticas. Este trabajo enfatiza la urgencia de futuros estudios e intervenciones sanitarias, educativas y epidemiológicas enfocadas en las comunidades rurales insulares más vulnerables de Nicaragua, especialmente en la región Caribe, bajo una perspectiva USS.