El artículo propone una interpretación de la obra médica de fray Agustín Farfán (ca.1531-1604) que se enmarca, por un lado, en el desarrollo de la medicina de la conversión en manos de la Orden de san Agustín y, por el otro, en el de una cultura médica novohispana marcada por un pluralismo de saberes y de prácticas sanadoras en continua negociación con los aspectos religiosos y, en consecuencia, en tensión dialéctica permanente entre las competencias de religiosos y sanadores en el ámbito de la salud y la enfermedad.