Downloads provided by UsageCounts
Bien que le genre Saccharomyces ait été étudié en profondeur, certaines espèces du genre n'ont pas encore été résolues avec précision ; un exemple en est S. bayanus, un taxon qui comprend des lignées génétiquement diverses de souches pures et hybrides. Cette diversité rend l'attribution et la classification des souches appartenant à cette espèce peu claires et controversées. Ils ont été subdivisés par certains auteurs en deux variétés (bayanus et uvarum), qui ont été élevées au niveau de l'espèce par d'autres. Dans ce travail, nous évaluons la complexité de 46 souches différentes incluses dans le taxon S. bayanus au moyen d'une analyse PCR-RFLP et par séquençage de 34 régions géniques et d'un gène mitochondrial. À l'aide des données de séquence, et sur la base de la souche de référence de S. bayanus var. bayanus NBRC 1948, un S. bayanus pur hypothétique a été reconstruit pour ces gènes qui présentaient des allèles avec des valeurs de similarité inférieures à 97% avec la souche de S. bayanus var. uvarum CBS 7001, et de 99-100% avec la portion non S. cerevisiae chez S. pastorianus Weihenstephan 34/70 et avec la nouvelle espèce S. eubayanus. Parmi les souches de S. bayanus étudiées, différents niveaux d'homozygotie, d'hybridation et d'introgression ont été trouvés ; cependant, aucune souche pure de S. bayanus var. bayanus n'a été identifiée. Ces hybrides de S. bayanus peuvent être classés en deux types : les hybrides homozygotes (type I) et les hybrides hétérozygotes (type II), indiquant qu'ils sont issus de processus d'hybridation différents. Par conséquent, un scénario d'évolution putatif impliquant deux événements d'hybridation différents entre une souche de S. bayanus var. uvarum et une souche européenne inconnue de S. eubayanus peut être postulé pour expliquer la diversité génomique observée dans nos souches de S. bayanus var. bayanus.
Aunque el género Saccharomyces se ha estudiado a fondo, algunas especies del género aún no se han resuelto con precisión; un ejemplo es S. bayanus, un taxón que incluye linajes genéticamente diversos de cepas puras e híbridas. Esta diversidad hace que la asignación y clasificación de cepas pertenecientes a esta especie sea poco clara y controvertida. Algunos autores los han subdividido en dos variedades (bayanus y uvarum), que otros han elevado al nivel de especie. En este trabajo se evalúa la complejidad de 46 cepas diferentes incluidas en el taxón S. bayanus mediante análisis PCR-RFLP y mediante secuenciación de 34 regiones génicas y un gen mitocondrial. Utilizando los datos de secuencia, y en base a la cepa de referencia S. bayanus var. bayanus NBRC 1948, se reconstruyó un hipotético S. bayanus puro para estos genes que mostraba alelos con valores de similitud inferiores al 97% con la cepa S. bayanus var. uvarum CBS 7001, y del 99-100% con la porción no S. cerevisiae en S. pastorianus Weihenstephan 34/70 y con la nueva especie S. eubayanus. Entre las cepas de S. bayanus en estudio, se encontraron diferentes niveles de homocigosidad, hibridación e introgresión; sin embargo, no se identificó ninguna cepa pura de S. bayanus var. bayanus. Estos híbridos de S. bayanus se pueden clasificar en dos tipos: homocigotos (tipo I) e híbridos heterocigotos (tipo II), lo que indica que se han originado por diferentes procesos de hibridación. Por lo tanto, se puede postular un supuesto escenario evolutivo que involucra dos eventos de hibridación diferentes entre una cepa de S. bayanus var. uvarum y una cepa de S. eubayanus europea desconocida para explicar la diversidad genómica observada en nuestras cepas de S. bayanus var. bayanus.
Although the genus Saccharomyces has been thoroughly studied, some species in the genus has not yet been accurately resolved; an example is S. bayanus, a taxon that includes genetically diverse lineages of pure and hybrid strains. This diversity makes the assignation and classification of strains belonging to this species unclear and controversial. They have been subdivided by some authors into two varieties (bayanus and uvarum), which have been raised to the species level by others. In this work, we evaluate the complexity of 46 different strains included in the S. bayanus taxon by means of PCR-RFLP analysis and by sequencing of 34 gene regions and one mitochondrial gene. Using the sequence data, and based on the S. bayanus var. bayanus reference strain NBRC 1948, a hypothetical pure S. bayanus was reconstructed for these genes that showed alleles with similarity values lower than 97% with the S. bayanus var. uvarum strain CBS 7001, and of 99-100% with the non S. cerevisiae portion in S. pastorianus Weihenstephan 34/70 and with the new species S. eubayanus. Among the S. bayanus strains under study, different levels of homozygosity, hybridization and introgression were found; however, no pure S. bayanus var. bayanus strain was identified. These S. bayanus hybrids can be classified into two types: homozygous (type I) and heterozygous hybrids (type II), indicating that they have been originated by different hybridization processes. Therefore, a putative evolutionary scenario involving two different hybridization events between a S. bayanus var. uvarum and unknown European S. eubayanus-like strains can be postulated to explain the genomic diversity observed in our S. bayanus var. bayanus strains.
على الرغم من أن جنس السكريات قد تمت دراسته بدقة، إلا أن بعض الأنواع في الجنس لم يتم حلها بدقة بعد ؛ مثال على ذلك هو S. bayanus، وهو تصنيف يتضمن سلالات متنوعة وراثيًا من السلالات النقية والهجينة. هذا التنوع يجعل تعيين وتصنيف السلالات التي تنتمي إلى هذا النوع غير واضح ومثير للجدل. تم تقسيمها من قبل بعض المؤلفين إلى نوعين (بايانوس و أوفاروم)، والتي تم رفعها إلى مستوى الأنواع من قبل الآخرين. في هذا العمل، نقوم بتقييم تعقيد 46 سلالة مختلفة مدرجة في صنف S. bayanus عن طريق تحليل PCR - RFLP وعن طريق تسلسل 34 منطقة جينية وجين واحد من الميتوكوندريا. باستخدام بيانات التسلسل، واستنادًا إلى سلالة S. bayanus var. bayanus المرجعية NBRC 1948، تمت إعادة بناء سلالة S. bayanus نقية افتراضية لهذه الجينات التي أظهرت أليلات ذات قيم تشابه أقل من 97 ٪ مع سلالة S. bayanus var. uvarum CBS 7001، و 99-100 ٪ مع الجزء غير S. cerevisiae في S. pastorianus Weihenstephan 34/70 ومع الأنواع الجديدة S. eubayanus. من بين سلالات S. bayanus قيد الدراسة، تم العثور على مستويات مختلفة من الزيجوت المتماثل والتهجين والانطواء ؛ ومع ذلك، لم يتم تحديد أي سلالات S. bayanus var. bayanus نقية. يمكن تصنيف هجائن S. bayanus هذه إلى نوعين: هجائن متماثلة الزيجوت (النوع الأول) وهجائن متباينة الزيجوت (النوع الثاني)، مما يشير إلى أنها نشأت من عمليات تهجين مختلفة. لذلك، يمكن افتراض سيناريو تطوري مفترض يتضمن حدثين مختلفين للتهجين بين سلالات S. bayanus var. uvarum وسلالات S. eubayanus الأوروبية غير المعروفة لشرح التنوع الجيني الملحوظ في سلالات S. bayanus var. bayanus.
Introgression, DIVERSITY, Sequence Homology, Plant Science, Polymerase Chain Reaction, Gene, Agricultural and Biological Sciences, https://purl.org/becyt/ford/1.6, PCR-RFLP analysis, Cluster Analysis, Phylogeny, SACCHAROMYCES EUBAYANUS, Phylogenetic analysis, Q, Genomic Expression and Function in Yeast Organism, R, Life Sciences, Microbial Interactions in Wine Production and Flavor, S. bayanus, Medicine, Polymorphism, Restriction Fragment Length, Research Article, Genetic Speciation, Science, Molecular Sequence Data, Saccharomyces cerevisiae, Genetic and Environmental Factors in Grapevine Cultivation, Genètica molecular, Saccharomyces, Species Specificity, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Genetics, YEAST, https://purl.org/becyt/ford/1, Molecular Biology, Biology, Alleles, Base Sequence, Botany, SACCHAROMYCES PASTORIANUS, Genetic Variation, Sequence Analysis, DNA, Hybrid, Genetics, Population, Haplotypes, FOS: Biological sciences, Hybridization, Genetic, Taxon, Food Science
Introgression, DIVERSITY, Sequence Homology, Plant Science, Polymerase Chain Reaction, Gene, Agricultural and Biological Sciences, https://purl.org/becyt/ford/1.6, PCR-RFLP analysis, Cluster Analysis, Phylogeny, SACCHAROMYCES EUBAYANUS, Phylogenetic analysis, Q, Genomic Expression and Function in Yeast Organism, R, Life Sciences, Microbial Interactions in Wine Production and Flavor, S. bayanus, Medicine, Polymorphism, Restriction Fragment Length, Research Article, Genetic Speciation, Science, Molecular Sequence Data, Saccharomyces cerevisiae, Genetic and Environmental Factors in Grapevine Cultivation, Genètica molecular, Saccharomyces, Species Specificity, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Genetics, YEAST, https://purl.org/becyt/ford/1, Molecular Biology, Biology, Alleles, Base Sequence, Botany, SACCHAROMYCES PASTORIANUS, Genetic Variation, Sequence Analysis, DNA, Hybrid, Genetics, Population, Haplotypes, FOS: Biological sciences, Hybridization, Genetic, Taxon, Food Science
| selected citations These citations are derived from selected sources. This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | 58 | |
| popularity This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network. | Top 10% | |
| influence This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | Top 10% | |
| impulse This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network. | Top 10% |
| views | 38 | |
| downloads | 41 |

Views provided by UsageCounts
Downloads provided by UsageCounts