En las dos últimas décadas se ha generalizado el uso de pruebas genéticas en los tribunales, permitiendo la identificación de criminales a partir de restos biológicos, la determinación de paternidades o la identificación de cadáveres. Menos conocidas son las periciales basadas en el uso de filogenias moleculares. En ellas se estudia la ancestralidad común de organismos, normalmente virus o bacterias, para establecer su asociación a una fuente de infección. Desde el caso del dentista de Florida, que infectó con el VIH a varios de sus pacientes, hasta el más próximo del anestesista Juan Maeso, que transmitió el VHC a cerca de 300 pacientes, la teoría evolutiva tiene un papel esencial en estas pruebas. En este artículo se explican las bases de esta aplicación de la teoría evolutiva.