Avec les guerres balkaniques, toute la région apprit à connaître un nouveau concept : le nettoyage ethnique. Les États cherchant à homogénéiser leur population le firent de deux manières : par les traités ou par la force. Les statistiques démographiques devinrent ainsi un instrument politique et commença alors « la manipulation ethnique ». Parmi les Chrétiens anatoliens, les Grecs ottomans furent la première cible du CUP qui craignait de perdre « le dernier territoire restant ». Talat Pacha, ministre de l'Intérieur parla aux diplomates allemands de débarrasser le pays « des ennemis de l’intérieur ». Expulsions, terreur et déportations : entre 1912 et 1918, sur les deux rives de l’Égée, près de la moitié des 17,5 millions d’habitants ont été « déplacés ». Le legs le pire de cette période est la tendance des États à croire qu’ils ont le droit d’échanger ou de déporter leurs populations comme du bétail.