El objetivo de este código es poner a disposición de cualquier usuario las herramientas de análisis utilizadas en la monografía La ganga ibérica y la ganga ortega en España. Población reproductora en 2019 y método de censo. Se usa para ello una generación de datos de acuerdo unos parámetros de detectabilidad y varias covariables que se definen por el usuario. Una vez obtenidos esos datos, se tratan en 𝑅 de acuerdo a las instrucciones que se detallan. Con estas simulaciones, cualquier usuario puede inspeccionar la estructura de los datos en su ordenador y hacer la misma tipología de análisis. El presente código detalla el análisis de ocupación multiescala o multinivel, que trabaja sobre dos niveles de muestreo; las cuadrículas UTM que son sobre las que se dan los resultados, y los transectos, que están en el interior de las cuadrículas, y constituyen las unidades básicas de muestreo, y que además se repiten en varias ocasiones para posibilitar la estima de la detección. Para replicar el análisis hay que copiar el texto de los recuadros. Tened en cuenta que las líneas que comienzan con # son sólo informativas o resultados.

El presente código, adaptado para ser ejecutado con la librería NIMBLE (de Valpine, 2017; NIMBLE Development Team, 2019) de R (R Core Team, 2020) es una adaptación del código de la página 600 y siguientes del libro de Kéry & Royle (2016). Una excelente recopilación de todos los códigos del libro, realizada por Mike Meredith, puede encontrarse en GitHub: (https://github.com/mikemeredith/AHM_code).

Códigos en R para simular datos y ajustar los modelos utilizados en los análisis de población de la ganga ibérica y ganga ortega.

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