Contexto: Uno de los problemas más importantes en el trabajo pedagógico en la Educación Superior es el proceso de formación de habilidades profesionales, lo que toma gran importancia porque es donde se forman los profesionales que deben aplicar creadoramente la información científica en la solución de los problemas que presenta la sociedad. Objetivo: Contribuir al desarrollo de habilidades profesionales en la asignatura Anatomofisiología animal. Métodos: Se emplearon métodos de investigación del nivel teórico y empírico, evidenciándose el insuficiente desarrollo de las habilidades profesionales en la asignatura Anatomofisiología animal, de los estudiantes de la carrera Educación Agropecuaria. Resultados: Se ofrece una guía metodológica que permite a los estudiantes para logren sistematizar las habilidades profesionales en la asignatura Anatomofisiología animal. Conclusiones: La guía metodológica que se presenta constituye una vía para el desarrollo de las habilidades profesionales en la asignatura Anatomofisiología animal, de los estudiantes de la carrera Educación Agropecuaria, a partir de la sistematicidad en la ejecución de acciones concretas, de manera flexible y con diferentes grados de complejidad.