プレバイオティクスとプロバイオティクスの作用機構に関する科学的理解は、近年大幅に進展しているとも言える。多くの場合、効果は菌株や製品に固有のものであるが、一部のプレバイオティクスとプロバイオティクスの効果は共通の機構によってもたらされるものもあり、したがって一般化できる可能性がある。学際的な研究環境で新しい生理的手段および分析手法を使用することで、更なる機構の解明が可能になるであろう。このようにして、プレバイオティクス、プロバイオティクス、シンバイオティクスの健康効果についての理解を深めることができる。