El principal objetivo del presente trabajo de investigación propone una guía sencilla para la generación de inventarios, monitoreos e identificaciones taxonómicas de las especies. Se realizó una búsqueda bibliográfica de las diferentes metodologías para la elaboración de inventarios divididos por taxones de los recursos biológicos de flora y fauna. En primer lugar, se tienen los inventarios de flora, en los cuales se menciona el nombre del método, la unidad de muestreo, diseño, tiempo, personal requerido y finalmente el tipo de análisis al que debe someterse cada uno de ellos; además, para la programación y ejecución de monitoreos de este recurso se considera el monitoreo de la vegetación dentro de una parcela permanente como método más efectivo. Por otro lado, para la generación de inventarios del recurso fauna se muestran diferentes metodologías divididas en taxones, cabe destacar que se realizó la descripción de los métodos tanto para captura y rastreo de especies de aves, mamíferos, reptiles, anfibios y peces; de este último se encuentra por separado la metodología para el muestreo de Macroinvertebrados Acuáticos MIA. Finalmente, se concluye que los inventarios y monitoreos de flora y fauna permiten gestionar adecuadamente la conservación, el manejo y la implementación de programas para la protección de las especies y su dinámica con los elementos que los rodean. Se espera que esta guía sea utilizada por estudiantes y docentes como una herramienta de campo.