El presente estudio tuvo como objetivo analizar la relación entre la comprensión lectora y el pensamiento crítico en estudiantes de noveno año de Educación General Básica Superior de una institución educativa fiscal ecuatoriana. La investigación se desarrolló bajo un enfoque cuantitativo, con diseño no experimental, de corte transversal y alcance correlacional. La población estuvo conformada por 200 estudiantes matriculados en noveno grado, correspondientes a la totalidad de paralelos de la jornada matutina y vespertina. Se trabajó con un muestreo censal, lo que permitió incluir al 100% de la población, eliminando el error muestral y garantizando un diagnóstico preciso y contextualizado. Para la recolección de datos se aplicaron dos cuestionarios estructurados con escala Likert de cinco puntos: el Cuestionario de Comprensión Lectora (CCL), compuesto por 25 ítems distribuidos en cinco dimensiones (literal, inferencial, crítica, metacognición y uso de estrategias), y el Cuestionario de Pensamiento Crítico (CPC), integrado por 24 ítems organizados en cuatro dimensiones (análisis, interpretación, evaluación y autorregulación). Ambos instrumentos fueron validados mediante juicio de expertos, obteniendo un coeficiente V de Aiken superior a 0,90, y su confiabilidad se determinó a través de una prueba piloto, con valores alfa de Cronbach de 0,89 para el CCL y 0,91 para el CPC, lo que indica una alta consistencia interna. Los resultados descriptivos evidenciaron que el 42,5% de los estudiantes se ubicó en un nivel bajo de comprensión lectora y el 46,5% en un nivel bajo de pensamiento crítico, con las mayores dificultades concentradas en las dimensiones de comprensión crítica y evaluación, respectivamente. El análisis inferencial, mediante el coeficiente de correlación de Pearson, reveló una relación positiva, alta y estadísticamente significativa entre ambas variables (r = 0,79; p < 0,001). Se concluye que existe una fuerte interdependencia entre la comprensión lectora y el pensamiento crítico en la población estudiada, lo que evidencia la necesidad de implementar estrategias pedagógicas integradas que fortalezcan simultáneamente ambas competencias para mejorar la calidad educativa en el nivel de básica superior.