Данная статья является итогом систематизации ключевых положений современных институциональных теорий (новой институциональной экономики, теории транзакционных издержек, теории регулирования и теории коллективного действия) для оценки перспектив построения комплексной модели институциональной архитектуры экосистем свободного программного обеспечения. Исследование основано на гипотезе, о том, что устойчивое внедрение свободного программного обеспечения (СПО) возможно только при формировании комплементарной архитектуры, где формальные нормы, организационные структуры и неформальные институты взаимно усиливают друг друга, снижая транзакционные издержки и преодолевая зависимость от иностранных поставщиков. Предложена трехуровневая модель институциональной архитектуры, а именно стратегический слой (государственная политика и регулирование), операционный слой (институциональная среда, данные и цифровые рынки) и технологический слой (цифровая инфраструктура и информационная безопасность). Модель обеспечивает синергетическое взаимодействие формальных институтов (законодательство, стандарты, KPI), организационно-координационных механизмов (центры компетенций, дорожные карты) и неформальных институтов (профессиональные сообщества, доверие), что позволяет преодолевать институциональные ловушки и формировать условия для адаптивного управления процессами обеспечения цифрового суверенитета. Результаты исследования демонстрируют, что эффективное внедрение СПО требует баланса между государственным контролем и автономией разработчиков через гибридные институциональные формы. Практическая значимость работы заключается в разработке методологических основ проектирования институциональных решений для государственного сектора, обеспечивающих технологическую независимость при сохранении открытости к глобальным инновационным процессам. Полученные результаты могут быть использованы для совершенствования государственной политики в области цифровой трансформации.