Este estudio analiza la eficiencia y productividad de los Organismos Operadores de Agua (OOA) en México durante el periodo 2016-2018, en un contexto donde los desafíos del sector hídrico incluyen la sobreexplotación de acuíferos, desigualdades tarifarias y baja cobertura efectiva de tratamiento. A través de las metodologías Data Envelopment Analysis (DEA) y el índice de Malmquist, se evaluó el desempeño técnico y la evolución de la productividad de 64 OOA, tomando en cuenta insumos como costos y número de empleados, y como producto el valor de la producción. Los resultados muestran una heterogeneidad significativa en el desempeño de los OOA. El análisis DEA reveló que la mayoría de las unidades operaban con niveles subóptimos de eficiencia técnica, atribuibles a problemas como escalas inadecuadas de operación, gestión deficiente o tecnología obsoleta. En tanto, el índice de Malmquist reflejó una ligera disminución en la productividad total de los factores, impulsada principalmente por una caída en la eficiencia técnica, pese a modestos avances tecnológicos. Los hallazgos sugieren que las diferencias en productividad responden más a factores internos organizacionales que a cambios tecnológicos a nivel sectorial. Por ello, se destaca la importancia de implementar intervenciones focalizadas que optimicen el uso de recursos, mejoren la gestión operativa y ajusten la escala de prestación del servicio. Asimismo, se recomienda que los OOA aprovechen las oportunidades tecnológicas disponibles. Finalmente, el estudio enfatiza la necesidad de análisis adicionales que exploren los determinantes contextuales de la eficiencia, como los marcos de gobernanza, inversión en infraestructura, regulación y participación comunitaria, con el fin de formular políticas que fortalezcan la sostenibilidad y el desempeño del sector agua en México.