Los recursos naturales están siendo sometidos a una mayor presión de contaminación con el paso del tiempo. Mantener sus condiciones sin contaminar es un reto a fin de preservarlos para las presentes y futuras generaciones. La degradación ambiental ha ocasionado que los recursos hídricos se vean fuertemente impactados, por lo que dicho proceso puede llevar a la degradación de los ecosistemas y a la correspondiente disminución de la calidad de vida, con altos costos económicos y sociales. Los ríos se convierten en uno de los recursos que han sufrido un fuerte deterioro por la presión humana que cada vez tiende a ser mayor. Con el fin de conocer la presencia de Familias y especies de peces en una longitud de 50.36 kilómetros del cauce del río Titihuapa, departamentos de Cabañas y San Vicente, El Salvador. El objetivo fue estimar las poblaciones de peces en un estudio de campo de tres meses (febrero, marzo y abril 2016), mediante muestreos no destructivos. Los resultados evidencian las limitadas cantidades, tanto en cantidad de individuos como de especies, encontrándose 4 familias con 9 especies de peces. La familia Cichlidae con 4 especies, seguido de Poeciliidae con 3 y Characidae y Ariidae con una especie cada una. De igual forma se encontró que las especies de peces más abundantes fueron Poeciliopsis pleurospilus (guatopote), Amatitlania nigrofasciata (burrita), Heterandria anzuetoy (chimbolo) y Astyanax aeneus (Plateada). Se identificó la presencia de parásitos Contracaecum sp. en las especies de peces Ariopsis guatemalensis y Heterandria anzuetoi. Un hallazgo importante fue que se observaron altas poblaciones del ave conocida a nivel local como Pato Chancho o cormorán de la especie Phalacrocorax brasilianus, el cual se relacionado con el parásito Contraecum