La presente investigación es acerca del Comité Nacional de Ética en la Investigación en Salud, de El Salvador, (CNEIS) su desarrollo, trayectoria, y proceso de institucionalización, con el fin de identificar los avances y desafíos en la gobernanza de la ética de la investigación, para asimismo, mostrar la contribución de dicho enfoque en la actividad científica sanitaria, en específico, en la investigación biomédica que se lleva a cabo en El Salvador. Entre los antecedentes, se desarrolla un panorama breve de la ética, la bioética como un saber normativo y una ética aplicada, la bioética clínica en Latinoamérica, también una reseña sobre la investigación biomédica. Por otra parte, se desarrolla el tema de los Comités de Ética de la Investigación (CEIS) su importancia social y científica, asimismo, se desarrolla un panorama sobre las pautas e instrumentos internacionales, y las Buenas Prácticas Clínicas. De igual manera, se elabora una sistematización sobre la trayectoria del CNEIS, un análisis sobre sus documentos regulatorios. Para este estudio, se ha elegido una metodología cualitativa de investigación documental sobre el CNEIS, ya que se cuenta con acceso a los archivos y a la información institucional. Es una monografía de compilación, por lo que es un estudio bastante teórico, que implica la búsqueda, análisis crítico, y evaluación de información y documentos. También constituye un conocimiento nuevo, tomando en cuenta aportes teóricos ya existentes, ya sea en literatura bioética, ética de la investigación, y reseñas sobre la experiencia salvadoreña de los primeros comités.