La serranía de San Lucas (Colombia) se considera de alto valor para la conservación de la biodiversidad, pero poco se sabe sobre su fauna. Entre finales de 2016 (lluvias) e inicios de 2017 (seca) se realizaron dos salidas de campo para caracterizar la fauna de anfibios y estimar su diversidad taxonómica en el río Cimitarra, al sur de esta serranía. Como resultado, se registraron 183 individuos pertenecientes a 23 especies, 15 géneros y 8 familias. Aunque la riqueza no difirió entre temporadas, la diversidad fue casi el doble en temporada seca que en la de lluvia, siendo el bosque natural fragmentado la cobertura más diversa con 14,2 especies (q1). La composición de anfibios fue diferente entre temporadas y coberturas, con altos valores de diversidad β debido principalmente al anidamiento en el ensamblaje. Los anfibios del río Cimitarra muestran un patrón de similitud con otras localidades dependiendo de su distancia geográfica. Estos resultados contribuyen con información para ser comparada con la diversidad de anfibios en áreas más intervenidas del Magdalena Medio y el bosque húmedo en general. Sin embargo, se debe analizar la dinámica espaciotemporal de los anfibios en una escala de tiempo mayor y evaluar las variaciones interanuales.