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Médecine et Maladies Infectieuses
Article . 2018 . Peer-reviewed
License: Elsevier TDM
Data sources: Crossref
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Approche syndromique pour le diagnostic de gastro-entérite : évaluation du panel PCR Multiplex FilmArray® GE, BioMérieux dans un hôpital général

Authors: N. Weiss; K. Riffaud; V. Blanc; P. Dubuis-Gourdange; Pierre-Marie Roger; J. Dorin; A. Sindt;

Approche syndromique pour le diagnostic de gastro-entérite : évaluation du panel PCR Multiplex FilmArray® GE, BioMérieux dans un hôpital général

Abstract

Introduction La coproculture standard est l’examen le plus frequemment prescrit en cas de gastro-enterite (GE), mais ne permet pas l’identification de tous les agents pathogenes. En fonction de l’anamnese et du contexte, un ensemble de techniques complementaires, dont le bon usage est complexe, peuvent ou doivent etre associees. Les errances et retards diagnostiques, hospitalisations inutiles et traitements inappropries sont ainsi frequemment observes. L’approche syndromique par PCR multiplex en temps reel apparait comme une nouvelle strategie face a cette question clinique. Nous avons mene une evaluation medico-economique de l’implantation du panel GE FilmArray®, BioMerieux (FA-GE) dans la prise en charge des GE dans un hopital general. Materiels et methodes De juin a aout 2017, tous les patients hospitalises et presentant des selles classees au moins 7 selon l’echelle de Bristol (SEB ≥ 7) ont ete inclus prospectivement (cas) et un FA-GE, incluant 22 pathogenes viraux, bacteriens et parasitaires, realise. L’etude etant non-interventionnelle, les demandes ont ete traitees en parallele selon les procedures habituelles associant des techniques conventionnelles et specifiques, externalisees si necessaire. Le resultat du FA-GE a ete communique au medecin responsable, qui etait libre de prendre en compte ou pas les resultats. Les temoins etaient des patients admis a l’hopital l’annee precedente a la meme periode, avec des criteres d’inclusion similaires, mais sans disponibilite de FA-GE. Les donnees recueillies comprenaient : le delai d’obtention des resultats, le cout des reactifs, les resultats microbiologiques, les donnees therapeutiques et la duree du sejour. Resultats Au cours de la periode d’etude de 2017, 61 cas ont ete inclus. Treize (21 %) diagnostics ont ete poses avec les protocoles habituels, et 16 de plus (26 %) plus avec FA-GE, soit un total de 29 cas positifs (47 %). En 2016, 58 temoins SEB ≥ 7 ont ete inclus, dont 12 (21 %) documentees. Le premier resultat positif etait obtenu en une heure en 2017 contre 5 heures en 2016. Les modifications therapeutiques precoces etaient plus frequentes en 2017 : 25 % contre 14 % des cas. La duree du sejour hospitalier etait raccourcie de 3,2 jours en 2017 par rapport a 2016. Conclusion Le FA-GE permet un criblage rapide et large au cours des GE et identifie un agent pathogene deux fois plus souvent que les protocoles habituels. L’experience croissante de l’approche syndromique devrait permettre d’evaluer la signification clinique de ces resultats.

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