Objetivo. Identificar las diferencias en el procesamiento cortical de emojis en personas con alta y baja empatía afectiva. Método. El estudio se llevó a cabo con 69 participantes, distribuidos en dos grupos –baja y alta empatía afectiva–, según su puntaje en el Índice de Reactividad Interpersonal. Cada participante observó emojis con expresiones de alegría, ira y neutros. Se registraron los potenciales relacionados a eventos (PRE) P100, N170 y LPP. Resultados. Se encontró una mayor amplitud del N170 en el grupo de personas con alta empatía afectiva y, en general, mayor magnitud del LPP ante emojis de ira. Conclusión. Los resultados sugieren que los emojis son procesados corticalmente de forma similar al rostro humano y que la empatía afectiva modula la codificación del emoji, pero no la atención temprana y el enganche atencional hacia estos estímulos.