O presente estudo teve como objetivo avaliar comparativamente a eficiencia dos terminais de conteineres dos portos da regiao sul do Brasil. Para tanto, utilizou-se o metodo da analise envoltoria de dados ou Data Envelopment Analysis (DEA). O DEA e indicado para comparar a eficiencia relativa de unidades de negocios utilizando diferentes inputs e outputs, ainda que os mesmos estejam em diferentes unidades de medida, uma vez que se trata de uma tecnica nao parametrica. Neste estudo, foram considerados como inputs os dados relativos a calado; extensao dos bercos, capacidade estatica e quantidade de gruas em cada terminal estudado e como outputs os dados relativos a quantidade de navios; movimentacao de conteineres e produtividade. A escolha de variaveis de input relacionadas a infraestrutura e variaveis de output associadas a operacao tomou como base estudos anteriores sobre eficiencia portuaria identificados na literatura. A aplicacao do DEA mostrou-se util e os resultados obtidos podem ser usados para orientar o processo de tomada de decisao nos portos estudados.