L'esposizione ripetuta del microbioma intestinale agli antibiotici, indispensabili nel controllo delle malattie, può causare una diminuzione della loro efficacia e lo sviluppo di popolazioni batteriche multi-resistenti, con gravi problemi, non solo di ordine clinico-terapeutico. Inoltre, gli antibiotici possono anche avere effetti dannosi sull'ecologia delle specie commensali della flora enterica; l’acquisizione di resistenza intrinseca nei batteri non patogeni può rappresentare inoltre un serbatoio per il trasferimento laterale dei geni di resistenza. Considerare il problema in una prospettiva interspecifica animale-uomo è l’unico modo per trovare una soluzione efficace a lungo termine.

Repeated exposure of the intestinal microbiome to antibiotics, which are essential in the control of diseases, can cause a decrease in their effectiveness and the development of multi-resistant bacterial populations with serious problem, not only of clinical and therapeutic order. In addition, antibiotics can also have damaging effects on the ecology of commensal species of enteric flora. The development of an intrinsic resistance in the non-pathogenic bacteria may also be a reservoir for the lateral transfer of the resistance genes. The evaluation of the problem in interpecific perspective animal-man is the only way to find an effective long term solution.