La presencia de los datos faltantes es un problema metodológico común de la investigación en salud. En este trabajo se han introducido los métodos imputación múltiple (MI) y ponderación por la probabilidad inversa (IPW) para tratar los datos faltantes y se han aplicado en el estudio UniverSal, un estudio multicéntrico y longitudinal que recoge información autorreportada de estudiantes universitarios sobre ideación y conducta suicida y los posibles factores de riesgo y protección. Se han estimado prevalencias de diferentes variables estudiadas y se ha aplicado un modelo de regresión Poisson de los posibles factores de riesgo y protección asociados con tener pensamiento o conducta suicida con el objetivo de comparar los resultados obtenidos al aplicar MI e IPW.