Il ciliegio (Prunus avium L.) è una specie diploide (2n= 2x = 16) appartenente alla famiglia delle Rosaceae che si sarebbe originato da due specie tetraploidi, P. cerasus e P. pseudocerasus. I frutti di ciliegio, apprezzati per la loro succosità e il sapore dolce, sono altamente ricchi di sostanze nutraceutiche che promuovono la salute (Mccune et al. 2011). La disponibilità del genoma del ciliegio (Shirasawa et al. 2017; Pinosio et al. 2020) consente la mappatura di migliaia di SNP (Single Nucleotide Polymorphism) ottenuti mediante tecnologia GBS (Genotyping-by-Sequencing). Nell'ambito del progetto PSR Basilicata BioDruBa (Biodiversità delle Drupacee della Basilicata), varietà locali di ciliegio lucane conservate nella collezione dell'ALSIA (Rotonda, PZ) sono state genotipizzate mediante tecnologia GBS insieme ad altre varietà note provenienti dalla collezione dell'Università di Bari, con le quali sono state confrontate. Le analisi di struttura di popolazione e delle componenti principali, nonché lo studio delle relazioni filogenetiche hanno evidenziato che la maggior parte delle varietà locali provenienti dalla Basilicata risulta geneticamente più vicina a varietà tradizionali campane, suggerendo una comune origine genetica. Gli altri materiali hanno mostrato raggruppamenti generalmente attribuibili a comuni origini genealogiche e/o condivisione di tratti morfoagronomici. Sono stati inoltre rilevati alcuni caratteri fenotipici ad elevata ereditarietà al fine di associare marcatori SNP con caratteri specifici, tramite analisi GWAS (Genome Wide Association Mapping). I risultati evidenziano l'associazione di alcuni SNP a caratteri di importanza agronomica.