Les organisateurs du séminaire Descartes en sont venus à organiser pour les doctorants et les post-doctorants un atelier annuel d’histoire de la philosophie moderne, entendue au sens large, incluant en particulier l’histoire des sciences. Cet atelier se tient alternativement en France et aux États-Unis. La première édition de cet atelier s’étant tenue à l’École normlae supérieure en 2013, en 2019, c’est la septième édition qui a lieu. Elle conjoint des exposés d'histoire des sciences et d’histoire de la philosophie moderne présentés par les doctorants ou les jeunes docteurs, laissant une large place à la discussion. et deux séances du séminaire Descartes, consacrées à la discussion d’ouvrages récents d'histoire de la philosophie et d’histoire des sciences.