La poda de los agrios siempre ha sido objeto de controversias y no sin razón. Al ser una actividad fundamentalmente manual, en la que el criterio humano tiene una gran importancia, la aplicación práctica de unas nomas previamente decididas puede variar mucho, no sólo en su conjunto de árboles, sino también entre los mismos operarios. Además de la poda, sobre la planta influyen multitud de factores: variedad, edad, sanidad y vigor, técnicas de cultivo, fertilidad del suelo, clima, etc., que deben tenerse muy en cuenta y que pueden hacer reaccionar al árbol en un sentido u otro y modificar los resultados esperados. Y así, sucede que las variadas respuestas de la planta, han creado confusión, no sólo con respecto a la necesidad de la poda sino también a su frecuencia, época, intensidad y sistema empleado, hasta el punto de que muchas veces se considera la poda como la última de las operaciones culturales a realizar en el huerto, practicándose tan sólo cuando los rendimientos o el potencial económico lo permiten. El limonero, por lo general, necesita de la poda más que otros agrios debido a su mayor vigor, que dificulta la realización de las operaciones de cultivo y la recolección, y con el fín de estimular la formación de ramas fructíferas y mejorar la calidad del fruto.