En molekylærbiologisk metode for typebestemmelse av enterovirus er under utprøving og skal etter hvert etableres på Mikrobiologisk avdeling ved Haukeland universitetssjukehus. Før etablering av metoden skal den være i stand til å identifisere de klinisk relevante enterovirus genotypene. Prøver som hadde testet positivt for enterovirus ved laboratoriet fra midten av 2018 til Januar 2020 ble forsøkt genotypet ved metoden. Metoden var en to-trinns revers transkriptase polymerase kjedereaksjon og en nested polymerase kjedereaksjon, etterfulgt av Sanger-sekvensering. Metodens sensitivitet og mulige påvirkninger på sensitiviteten ble undersøkt. Ved å analysere alle enterovirus-positive prøver fra 2019 fikk man i tillegg en periodisk oversikt. Av 120 prøver ble 99 typet (82,5%), fordelt på 15 ulike genotyper. Mulige påvirkninger på metodens sensitivitet ble undersøkt, og konsentrasjon av enterovirus i prøvene viste seg å være den viktigste. En korrelasjonstest viste en signifikant sammenheng mellom virusinnhold og mulighet for typing, hvor viruset i prøvene med lav konsentrasjon av enterovirus var vanskeligst å type. Av de 77 prøvene fra 2019 ble 55 typebestemt (77,5%), og coxsackievirus A6 ble detektert i 52,1% grunnet et utbrudd av hånd-, fot- og munnsyke. Coxsackievirus A6 ble detektert i flest sår- og blemmesekret, men også i spinalvæske i ett tilfelle. Problemer med deteksjon av enterovirus A71 førte til at metoden ble endret mot slutten av prosjektet. Nye primere ble utprøvd, og den modifiserte metoden ga langt bedre resultater ved deteksjon av denne genotypen. Vi fikk ikke anledning til å prøve ut de modifiserte primerne fullstendig, slik at videre utprøving er nødvendig.