Le condizioni ottimali di funzionamento della tecnica eddy covariance richiederebbero la presenza di stazionarietà dei flussi e sufficiente turbolenza. Tuttavia tali presupposti sono non sempre verificati (soprattutto in ore notturne e condizioni meteorologiche avverse). In questo senso diventa essenziale sia lo studio di particolari fenomeni nello strato limite che potrebbero condizionare le misure, sia la verifica diretta della qualità dei dati. In questo contributo, nella prima parte sono analizzate le condizioni di vento debole, con particolare riferimento al fenomeno del meandering. Le caratteristiche spettrali e le funzioni di autocorrelazione della velocità del vento e della temperatura sono anch'esse descritte. Nella seconda parte è proposta un'analisi della qualità dei dati delle misure eddy covariance, nonché l'impatto delle scelte sulla procedura di rotazione degli assi di anemometro e analizzatore di gas sui flussi stimati.