Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/ Ege University Insti...arrow_drop_down
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
addClaim

Memelilerde prion geninin (PRNP) biyoinformatik analizi

Authors: Takan, Işıl;

Memelilerde prion geninin (PRNP) biyoinformatik analizi

Abstract

PRNP geni, en yüksek düzeyde merkezi sinir sisteminde ifade olmak üzere birçok dokuda ifade olan hücresel prion proteinini kodlamaktadır. Prion proteininin, alfaheliks yaprakçıklarca zengin olan normal hücresel formu(PrPc) ve nörodejeneratif hastalıklara neden olan beta-tabakalarca zengin olan patojenik formu(PrPsc) olmak üzere iki izoformu bulunmaktadır. Patojenik prion proteini, insanda CJD, sığırlarda BSE, koyun ve keçide scrapie olarak isimlendirilen bulaşıcı nörodejeneratif ensefalit(TSE)lere neden olmaktadır. PRNP geni dizilerinde bu hastalıklara dirençlilik ve duyarlılık ile ilişkili polimorfizmler saptanmıştır. Ancak, dirençliliğe ve duyarlılığa neden olan bu değişimlerin mekanizması tam olarak aydınlatılamamıştır. Buna rağmen, farklı memeli türlerindeki polimorfizimleri analiz ederek, direnç mekanizmasıyla ilgili açıklamalar yapmak mümkündür. Bu çalışmada, 15 memeli türünde, PRNP geni dizilerindeki, polimorfizimler, kodon kullanım frekansları ve filogenetik ilişkiler analiz edilmiştir. Dizi veri setleri için NCBI ve EMBL nükleotid veri bankalarından yararlanılmıştır. Veri setlerinin işlenmesi için MEGA 5 programı kullanılmıştır. Çalışmanın sonuçları, farklı evrimsel uzaklıktaki memeli türleri arasında farklı dizi profilleri bulunduğunu göstermektedir. Bu farklılıklar ise dirençlilik ve duyarlılıkla ilişkili olduğuna işaret ediyor olabilir.

Country
Turkey
Related Organizations
Keywords

Biyoloji A.B.D., PRNP gene, codon usage frequency, phylogenetic tree., PRNP geni, Prion hastalıkları, Kodon Kulllanım Frekansı, Filogenetik Analiz.

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    0
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Average
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
0
Average
Average
Average
Green