Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
image/svg+xml Jakob Voss, based on art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina and Beao Closed Access logo, derived from PLoS Open Access logo. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Closed_Access_logo_transparent.svg Jakob Voss, based on art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina and Beao Ege University Insti...arrow_drop_down
image/svg+xml Jakob Voss, based on art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina and Beao Closed Access logo, derived from PLoS Open Access logo. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Closed_Access_logo_transparent.svg Jakob Voss, based on art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina and Beao
addClaim

Sekans temelli tanılanan Yarrowia lipolytica suşlarının yıldız ağ analizi

Star network analysis of sequence based identified Yarrowia lipolytica strains
Authors: Onur Akpınar; Emir Haliki; Füsun Bahriye Uçar; Alev Haliki Uztan;

Sekans temelli tanılanan Yarrowia lipolytica suşlarının yıldız ağ analizi

Abstract

Amaç: Bu çalışmanın amaçları, öncelikle dış-grup içeren ve içermeyen tanısı yapılmış Y. lipolytica suşlarının filogenetik ağaçlarının yıldız ağ analizidir. İkinci olarak filogenetik ağaçlardaki out-grupların önemsizliğinin gösterilmesidir.Materyal ve metotlar: Bu çalışmada 26S rDNA bölgesinin D1/D2 domainlerinin sekanslanmasıyla tanılanmış olan 22 Yarrowia lipolytica suşları kullanılmış ve dış-grup içeren ve içermeyen iki filogenetik ağaç neighbor joining yöntemi ile oluşturulmuştur. Bu iki filogenetik ağacın ağırlıklandırılmış yıldız ağ analizi incelenmiştir.Bulgular: Dış-grup içeren ağırlıklandırılmış filogenetik ağımızın bitişiklik matris ifadesi yönelimli bir yıldız şekilli bitişiklik matrisi ifadesine benzemektedir. En küçük ağırlık en ince hatta karşılık gelen, merkezi düğümden Candida sake dış-grubuna gelen hattır (0.00008). Bununla birlikte, merkezi düğümden Yarrowia lipolytica TEM YL 19 düğümüne giden hattın ağırlığı 0.0825 olup en kalın yapıyı teşkil eder.Sonuç: Ağ analizi, yakın suşlar ve alt türler arasındaki filogenetik ilişki doğrulanmıştır ve bu filogenetik ağaçlardaki dış-grup, ağırlıklandırılmış ortalama derecesinde göz ardı edilebilir değişiklikten ve bu nicelik üzerinden yapılan bazı istatistiksel hesaplamalardan dolayı gerekli değildir.

Country
Turkey
Related Organizations
Keywords

Biyokimya ve Moleküler Biyoloji

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    0
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Average
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
0
Average
Average
Average
Upload OA version
Are you the author of this publication? Upload your Open Access version to Zenodo!
It’s fast and easy, just two clicks!