
handle: 11454/10282
Amaç: Bu çalışmanın amaçları, öncelikle dış-grup içeren ve içermeyen tanısı yapılmış Y. lipolytica suşlarının filogenetik ağaçlarının yıldız ağ analizidir. İkinci olarak filogenetik ağaçlardaki out-grupların önemsizliğinin gösterilmesidir.Materyal ve metotlar: Bu çalışmada 26S rDNA bölgesinin D1/D2 domainlerinin sekanslanmasıyla tanılanmış olan 22 Yarrowia lipolytica suşları kullanılmış ve dış-grup içeren ve içermeyen iki filogenetik ağaç neighbor joining yöntemi ile oluşturulmuştur. Bu iki filogenetik ağacın ağırlıklandırılmış yıldız ağ analizi incelenmiştir.Bulgular: Dış-grup içeren ağırlıklandırılmış filogenetik ağımızın bitişiklik matris ifadesi yönelimli bir yıldız şekilli bitişiklik matrisi ifadesine benzemektedir. En küçük ağırlık en ince hatta karşılık gelen, merkezi düğümden Candida sake dış-grubuna gelen hattır (0.00008). Bununla birlikte, merkezi düğümden Yarrowia lipolytica TEM YL 19 düğümüne giden hattın ağırlığı 0.0825 olup en kalın yapıyı teşkil eder.Sonuç: Ağ analizi, yakın suşlar ve alt türler arasındaki filogenetik ilişki doğrulanmıştır ve bu filogenetik ağaçlardaki dış-grup, ağırlıklandırılmış ortalama derecesinde göz ardı edilebilir değişiklikten ve bu nicelik üzerinden yapılan bazı istatistiksel hesaplamalardan dolayı gerekli değildir.
Biyokimya ve Moleküler Biyoloji
Biyokimya ve Moleküler Biyoloji
| selected citations These citations are derived from selected sources. This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | 0 | |
| popularity This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network. | Average | |
| influence This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | Average | |
| impulse This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network. | Average |
