The objectives of this study were to do a survey of the autoimmune skin diseases and update the records regarding the occurrence of discoid lupus erythematosus in canine and feline populations attended at the Dermatology Service of the College of Veterinary Medicine and Animal Science of UNESP - Botucatu, including species, gender, breed, age, location and characteristic of the lesions. Results have shown that the order of occurrence, regarding the number of cases of autoimmune skin diseases in the animals attended by the Dermatology Service in the period from 1988 to 2007 was: discoid lupus erythematosus, pemphigus folliaceus, uveo-dermatologic syndrome, pemphigus vulgaris, systemic lupus erythematosus, necrolytic migratory erythema, multiforme erythema and plasmacytic pododermatitis. All the animals with discoid lupus erythematosus were dogs and most of them were mongrel females. More frequently breeds affected by discoid lupus erythematosus were german shepherd and akita and the mean age was 56 months. Most lesions were located in nasal planum, narines and periocular area and were characterized by crusting, depigmentation and erythema.Os objetivos do presente trabalho teve como objetivo fazer um levantamento da casuística de doenças dermatológicas auto-imunes e atualizar os dados referentes à ocorrência de lupus eritematoso discóide na população canina e felina atendida pelo Serviço de Dermatologia Veterinária da FMVZ-UNESP, campus de Botucatu, incluindo a espécie, sexo, raça, idade, localização e caracterização das lesões. Com a análise dos resultados, concluiu-se que a ordem de ocorrência de acordo com o número de casos de doenças dermatológicas auto-imunes nos animais atendidos pelo setor de dermatologia no período de 1988 a 2007 é: lupus eritematoso discóide, pênfigo foliáceo, síndrome úveo-dermatológica, pênfigo vulgar, lupus eritematoso sistêmico, eritema necrolítico migratório, eritema multiforme e pododermatite plasmocitária. Dos animais com lupus eritematoso discóide, todos eram da espécie canina, sendo a maioria fêmea e sem definição racial. As raças mais acometidas por lupus eritematoso discóide foram: Pastor Alemão e Akita e a média das idades foi de 56 meses. Notou-se que a maioria das lesões era localizada em plano nasal, narinas e região periocular. As lesões mais comumente observadas foram: crosta, despigmentação e eritema.