Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/ University of Bergen...arrow_drop_down
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
Bergen Open Research Archive - UiB
Doctoral thesis . 2023
License: CC BY NC ND
versions View all 2 versions
addClaim

Structural elements determining NAMPT activity

Authors: Houry, Dorothée;

Structural elements determining NAMPT activity

Abstract

Nikotinamidadenindinukleotid (NAD) er en hydridbærer involvert i redoksreaksjoner i metabolismen. I tillegg er NAD+ et substrat av enzymer som medierer vitale NAD+-avhengige prosesser, der dinukleotidet spaltes, og frigjør en nikotinamiddel (Nam). Vedlikehold av disse prosessene krever en kontinuerlig påfyll av NAD, som hovedsakelig gjøres av Nam-bergingsveien hos pattedyr. Det hastighetsbegrensende enzymet til denne veien, nikotinamidfosforibosyltransferase (NAMPT), bruker Nam og fosforibosylpyrofosfat (PRPP) som substrater for hvilke affiniteten øker etter NAMPTs autofosforylering på histidin 247 (pHis247) i en aktiv aminosyre. Interessant nok har pattedyret NAMPT en eksepsjonelt høy affinitet for Nam sammenlignet med bakterielle enzymer. Målet med studien var å definere de strukturelle tilpasningene til NAMPT som fører til en så høy affinitet for substratet, samt det strukturelle grunnlaget for reguleringen av Nam-affinitet. Multippel proteinsekvensjustering identifiserte i deuterostom NAMPT forekomsten av en strekning på ti aminosyrer som danner en fleksibel overflateløkke (β1-β2-løkke). Vi undersøkte derfor den mulige innvirkningen av denne løkken på proteinstrukturen, aktiviteten og substrataffiniteten ved å bruke en mutant som mangler disse ti aminosyrene. Sletting av β1-β2-løkken reduserte drastisk affiniteten for Nam mens den generelle strukturen stort sett forble upåvirket. Videre ble et antatt kjernefysisk lokaliseringssignal identifisert i β1-β2-sløyfen. Imidlertid kunne vi ikke bekrefte dets involvering i NAMPT subcellulær lokalisering. For å forstå hvordan pHis247 regulerer Nam-affinitet i NAMPT, sammenlignet vi bindingen av det native substratet og nikotinsyre, som har en langt lavere affinitet, ved røntgenkrystallografi og aktivitetsanalyser. Analysene førte til at vi foreslår at koordineringen av Mg2+ av fosfatgruppen til pHis247 optimaliserer posisjoneringen av PRPP, og dermed favoriserer reaksjonen med pyridinbasen. Det evolusjonære utvalget av Nam-berging av NAMPT hos høyere dyr faller sammen med både en diversifisering av NAD-avhengig signalering og forekomsten av β1-β2-løkken. Denne β1-β2-sløyfen ser ut til å være nødvendig for å møte behovet for svært effektiv Nam-resirkulering, i tillegg til fosforyleringen av His247. Dette arbeidet gir ny innsikt i utviklingen og den katalytiske mekanismen til et viktig NAD-biosyntetisk enzym.

Country
Norway
Related Organizations
Keywords

570

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    0
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Average
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
0
Average
Average
Average
Green
Related to Research communities