I den mikrobiologiske delen av tilsynsprogrammet for skjell, ble det i 2011 tatt ut i alt 384 prøver fordelt gjennom hele året. Av disse var 312 prøver av blåskjell (Mytilus edulis), 40 av kamskjell (Pecten maximus), 21 av østers (Ostrea edulis), fire av oskjell (Modiolus modiolus) og syv av strandsnegl (Littorina littorea). Prøvene ble sendt til Nasjonalt institutt for ernærings- og sjømatforskning (NIFES) i henhold til instruks utarbeidet av Mattilsynet, Seksjon for fisk og sjømat. Ved NIFES ble alle prøvene analysert for E. coli og til sammen 369 av prøvene ble analysert for enterokokker. Til sammen 38 av prøvene ble også analysert med hensyn på Salmonella. Antall E. coli ble bestemt ved en flerrørs fortynningsmetodikk (MPN) i henhold til EUs referansemetode (Donovans metode, ISO ), mens enterokokker ble bestemt ved hjelp av NMKL metode nr. 68, 5. utgave 2011: Enterococcus, bestemmelse i næringsmidler. Prøvene ble analysert med hensyn på forekomst av Salmonella ved hjelp av en automatisert immunologisk metodikk (ELFA, Vidas Salmonella), kombinert med konvensjonell dyrkning og verifikasjon for eventuelle positive prøver. Innholdet av E. coli var under 230/100 g i 323 (84 %) av de 384 prøvene som ble undersøkt, og kom dermed under EUs grenseverdi for klassifisering av dyrkingslokaliteter til såkalte A-områder. De øvrige 61 prøvene (16 %) hadde innhold av E. coli over 230/100 g. Høyeste avleste konsentrasjoner av E. coli for blåskjell var på over /100 g, for kamskjell 750 /100 g, for østers 3 500/100 g, for oskjell 20 /100 g og for strandsnegl 2 400/100 g. Av prøvene som ble undersøkt med tanke på E. coli, var 49 fra sluttprodukter, og fordelte seg med 31 av kamskjell, 12 av blåskjell, fire av oskjell og to av strandsnegl. Av disse hadde en prøve E. coli i konsentrasjoner over 230/100g. Dette var en prøve av blåskjell tatt ut i Sogn og Fjordane, der påvist mengde var /100g. Enterokokker kunne påvises i fem av de 369 undersøkte prøvene. Konsentrasjonene for fire av de positive prøvene var lik påvisningsgrensen, som for denne parameteren er 100 enterokokker/g skjellmat, mens én prøve hadde 200 enterokokker/g skjellmat. Alle positive prøver var av blåskjell. Det ble ikke funnet Salmonella-bakterier i noen av de 38 undersøkte prøvene fra tilsynsprogrammet. I tillegg til prøver innsendt av Mattilsynet, som en del av dette overvåkingsprogrammet, ble det også gjennomført mikrobiologisk analyse av 96 prøver innsendt av næringen. Innholdet av E. coli var under 230/100 g i 80 av disse prøvene (83 %). De øvrige 16 prøvene (17 %) hadde innhold av E. coli over 230/100 g. Høyeste avleste konsentrasjoner av E. coli for blåskjell var på /100 g og for hjerteskjell 9 100/100 g. Enterokokker kunne påvises i en av 18 undersøkte prøver. Prøven var av blåskjell og konsentrasjonen var lik påvisningsgrensen på 100 enterokokker/g skjellmat. Det ble ikke funnet Salmonella-bakterier i noen av de 5 undersøkte prøvene innsendt av næringen.

Tilsynsprogrammet for skjell 2011 - fremmedstoffer (tungmetaller og organiske miljøgifter i skjell og tungmetaller i snegler) og mikroorganismer.