
handle: 11250/2610795
MRSA er gule stafylokokker, Staphylococcus aureus, som har utviklet resistens mot nesten alle β-laktamantibiotika, og skyldes ervervelse av mecA- eller mecC-genet. Formålet med denne bacheloroppgaven var å etablere en TaqMan real-time PCR-metode for deteksjon av mecC hos MRSA. Dette var ønskelig blant annet fordi dagens metode med konvensjonell PCR er tidkrevende. I tillegg påviser ikke den nåværende metoden mecC-genet i ekstern kvalitetskontroll fra Quality Control for Molecular Diagnostics. Etableringen av real-time PCR for påvisning av mecC tok utgangspunkt i en tidligere publisert metode og ble optimalisert for bruk ved referanselaboratoriet. Metoden ble validert ved undersøkelse av sensitivitet, effektivitet og spesifisitet, både med og uten ROX som passiv referanse. I tillegg ble det undersøkt om metoden påviser mecC i den eksterne kvalitetskontrollen og om SYBR Green kan brukes som et alternativ til TaqMan. Den optimaliserte real-time PCR-metoden har høy sensitivitet (copy number/antall bakterier: 27,8) og effektivitet (98,0 %). Real-time PCR-metoden viser god spesifisitet, da resultatene for alle de 52 bakterieisolatene i valideringspanelet samsvarer med konvensjonell PCR. Alle de 29 bakterieisolatene som fikk påvist mecC-genet ved real-time PCR var ved fenotypisk resistensbestemmelse resistente mot cefoxitin. Dette tyder på overensstemmelse mellom real-time PCR og fenotypisk resistensbestemmelse med cefoxitin. Den optimaliserte real-time PCR-metoden påviser mecC-genet i ekstern kvalitetskontroll. Real-time PCR-metode med ROX gir en bedre baselinjebestemmelse enn tilsvarende metode uten ROX. Den optimaliserte real-time PCR-metoden er raskere å utføre enn den konvensjonelle PCR-metoden, og viser høy sensitivitet, effektivitet og spesifisitet. Dagens konvensjonelle PCR-metode for påvisning av mecC kan erstattes med TaqMan real-time PCR-metoden som er optimalisert i denne oppgaven.
| selected citations These citations are derived from selected sources. This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | 0 | |
| popularity This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network. | Average | |
| influence This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically). | Average | |
| impulse This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network. | Average |
