Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/ Norwegian Open Resea...arrow_drop_down
image/svg+xml art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos Open Access logo, converted into svg, designed by PLoS. This version with transparent background. http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Open_Access_logo_PLoS_white.svg art designer at PLoS, modified by Wikipedia users Nina, Beao, JakobVoss, and AnonMoos http://www.plos.org/
versions View all 1 versions
addClaim

Etablering av realtime-PCR for påvisning av mecC hos meticillinresistente Staphylococcus aureus (MRSA)

Authors: Larsen, Lena Rosvoll; Kalmár, Celine Irén Håkonsen;

Etablering av realtime-PCR for påvisning av mecC hos meticillinresistente Staphylococcus aureus (MRSA)

Abstract

MRSA er gule stafylokokker, Staphylococcus aureus, som har utviklet resistens mot nesten alle β-laktamantibiotika, og skyldes ervervelse av mecA- eller mecC-genet. Formålet med denne bacheloroppgaven var å etablere en TaqMan real-time PCR-metode for deteksjon av mecC hos MRSA. Dette var ønskelig blant annet fordi dagens metode med konvensjonell PCR er tidkrevende. I tillegg påviser ikke den nåværende metoden mecC-genet i ekstern kvalitetskontroll fra Quality Control for Molecular Diagnostics. Etableringen av real-time PCR for påvisning av mecC tok utgangspunkt i en tidligere publisert metode og ble optimalisert for bruk ved referanselaboratoriet. Metoden ble validert ved undersøkelse av sensitivitet, effektivitet og spesifisitet, både med og uten ROX som passiv referanse. I tillegg ble det undersøkt om metoden påviser mecC i den eksterne kvalitetskontrollen og om SYBR Green kan brukes som et alternativ til TaqMan. Den optimaliserte real-time PCR-metoden har høy sensitivitet (copy number/antall bakterier: 27,8) og effektivitet (98,0 %). Real-time PCR-metoden viser god spesifisitet, da resultatene for alle de 52 bakterieisolatene i valideringspanelet samsvarer med konvensjonell PCR. Alle de 29 bakterieisolatene som fikk påvist mecC-genet ved real-time PCR var ved fenotypisk resistensbestemmelse resistente mot cefoxitin. Dette tyder på overensstemmelse mellom real-time PCR og fenotypisk resistensbestemmelse med cefoxitin. Den optimaliserte real-time PCR-metoden påviser mecC-genet i ekstern kvalitetskontroll. Real-time PCR-metode med ROX gir en bedre baselinjebestemmelse enn tilsvarende metode uten ROX. Den optimaliserte real-time PCR-metoden er raskere å utføre enn den konvensjonelle PCR-metoden, og viser høy sensitivitet, effektivitet og spesifisitet. Dagens konvensjonelle PCR-metode for påvisning av mecC kan erstattes med TaqMan real-time PCR-metoden som er optimalisert i denne oppgaven.

  • BIP!
    Impact byBIP!
    selected citations
    These citations are derived from selected sources.
    This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    0
    popularity
    This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
    Average
    influence
    This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
    Average
    impulse
    This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
    Average
Powered by OpenAIRE graph
Found an issue? Give us feedback
selected citations
These citations are derived from selected sources.
This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Citations provided by BIP!
popularity
This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.
BIP!Popularity provided by BIP!
influence
This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).
BIP!Influence provided by BIP!
impulse
This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.
BIP!Impulse provided by BIP!
0
Average
Average
Average
Green