La comunidad planctónica es indispensable para el correcto funcionamiento de las redes tróficas marinas, así como multitud de ciclos biogeoquímicos. Se caracterizan por una alta capacidad de adaptación a la variabilidad ambiental, elevada diversidad y gran amplitud en el rango de tamaños que pueden encontrarse. Los métodos automáticos constituyen una herramienta muy adecuada para el estudio de las mismas a través de su composición taxonómica y del espectro de tamaños. Por su parte, el estrecho de Gibraltar resulta ser una zona clave para el estudio de estas comunidades por la variedad de forzamientos físicos que allí tienen lugar a diferentes escalas espaciales y temporales y la heterogeneidad en las propiedades físicas, químicas y biológicas que eso produce, dando lugar a gradientes muy marcados en términos de productividad, por ejemplo. El propósito de esta Tesis, es la caracterización de la estructura de la comunidad planctónica en la zona de influencia del estrecho de Gibraltar con énfasis en la respuesta biológica asociada a la intensa hidrodinámica de la zona. Con ese propósito se analizan la estructura de tamaños de la comunidad planctónica, su composición taxonómica, los posibles cambios sufridos en las aguas que atraviesan el Estrecho a diferentes escalas. Atendiendo a la escala espacial, la zona del Estrecho queda dividida en dos zonas según sus características físico-químicas, por un lado, la zona de Trafalgar y casi toda la costa española y por otro la zona central de canal y toda la que recibe una mayor influencia del golfo de Cádiz. Ambas soportan comunidades planctónicas muy diferentes, siendo la comunidad en las zonas costeras altamente productiva y dominada por diatomeas de gran tamaño (géneros Guinardia, Rhizosolenia, Chaetoceros, Proboscia, Leptodylindrus y Lauderia, así como diatomeas centrales formando cadenas) que suponen el 79% de la abundancia relativa. La zona oeste, y el canal en cambio están dominados por fitoplancton pequeño (Prochlorococcus y Skeletonema) así como dinoflagelados y tintínidos. En cuanto al zooplancton la comunidad en ambas zonas está compuesta principalmente por copépodos, pero las zonas costeras presentaron una alta biomasa de larvas meroplanctónicas (31%) frente a la zona del canal. Los procesos de mezcla derivados de los episodios de mareas vivas, constituyen una inyección de nutrientes que actúa como propulsor de la productividad primaria, dando lugar a que la mayor parte de los grupos taxonómicos estudiados alcancen mayores biomasas, pero especialmente las diatomeas que llegan a triplicar la cifra con respecto a mareas muertas (75 vs. 25 mgC m-3). Además, durante los procesos de ondas internas, se transportan masas de agua costeras al canal central. Estas manchas de clorofila, están formadas por una comunidad fitoplanctónica muy activa y un suministro reciente de nutrientes que se transportan hasta el mar de Alborán en buenas condiciones para su crecimiento. En la estructura vertical de la comunidad fitoplanctónica se observan tres tipos de máximo, en este trabajo sólo se ha podido establecer una clara diferencia con respecto a uno de ellos, los máximos de succión, que están relacionados con las manchas de clorofila procedentes de zonas costeras y que se transportan hacia el canal integrándose en la estructura vertical de la comunidad. Estos máximos se caracterizan principalmente por la predominancia de especies del género Chaetoceros, propio de zonas costeras y de afloramiento.