Se ha estudiado la variabilidad espacial y reactividad del metano y el óxido nitroso a lo largo del gradiente de salinidad en el estuario del río Guadalquivir. Las muestras fueron tomadas a bordo del B/O UCADIZ en septiembre de 2021 y en febrero de 2022. Las concentraciones de ambos gases se han cuantificado mediante cromatografía de gases. Se ha observado que la concentración de CH4 y N2O aumenta hacia el interior del estuario. El CH4 alcanza un valor máximo relativo en la zona donde se localiza el tapón de turbidez y el N2O los alcanza en la zona más interna. Esta distribución se ve influenciada, principalmente, por los procesos de remineralización de la materia orgánica en los sedimentos y por los aportes laterales desde las zonas de marisma. El estuario se comporta como una fuentes de estos gases a la atmósfera con flujos positivos que aumentan hacia el interior del sistema. El intervalo de variación de los flujos de CH4 ha estado comprendido entre 130,5 y 29,6 µmol·m-2·d-1 y para el N2O entre 47,3 y 3,3 µmol·m-2·d-1. El estudio de reactividad de estos gases en la columna de agua a diferentes salinidades muestra que las velocidades de oxidación de CH4 y las de producción de N2O adquieren mayor importancia a salinidades más bajas.