RESUMEN: La tesis de doctorado introduce elementos claves para abordar una nueva teoría de los sistemas agrícolas inteligentes, basado en el concepto de los sistemas complejos adaptativos y donde se resaltan atributos adyacentes a la construcción de un modelo resiliente y sostenible llamado los Faros Agroecológicos, propuesta que se aborda en el modelo teórico. La metodología utilizada se basó en los métodos mixtos y métodos de análisis cualitativos. El estudio estuvo acompañado de un análisis de la sostenibilidad, utilizando indicadores del MESMIS (Marco para la Evaluación de Sistemas de Manejo Incorporando Indicadores de Sustentabilidad), (Masera et al., 1999). Para el caso de los objetivos dos y el diseño del modelo teórico del objetivo tres el enfoque utilizado fue cualitativo, basado en revisión documental. El modelo teórico permitió observar y analizar la conectividad de relaciones existentes de una cadena de producción agrícola en una situación real, es decir, un modelo que orienta hacia el análisis desde la demanda y no desde la oferta productiva. Se deduce de esta conectividad los componentes funcionales que permiten describir la evolución de las dinámicas energéticas y a la cual hemos denominado como: trinomio de la complejidad en los sistemas de producción agrícola, basado en la interacción entre Flujos - Procesos y Estructuras, que parten de la demanda hasta el sistema productivo. En síntesis, el modelo teórico, nos permitió definir la funcionalidad y estructura de lo que inicialmente llamamos Faros Agroecológicos. En consecuencia, Los Faros Agroecológicos son sistemas de producción que responden a una coordinación y evolución de la energía, manifestada en flujos de información y de la materia en una conectividad permanente con el entorno de la sociedad y sus reglas.