RESUMEN : En Colombia, la asignación de compensaciones por pérdida de biodiversidad aplica métricas de factores basados en la medición de cuatro criterios de las diferentes versiones del mapa de ecosistemas: rareza, representatividad, remanencia y tasa de transformación. Sin embargo, estas métricas de asignación de compensaciones no involucran todas las variables necesarias para determinar los impactos sobre la biodiversidad, limitándose a una evaluación de la condición del hábitat en una escala muy amplia y con información general que no incluye variables claves de biodiversidad. Esta investigación presenta una alternativa metodológica a la asignación de compensaciones en Colombia que provee una información más acertada para alcanzar la ganancia neta de biodiversidad con base en una métrica que incluye criterios relacionados con la distintividad del hábitat, condición y evaluación de la capacidad de oferta de servicios ecosistémicos de las áreas donde se generan impactos residuales. La investigación se desarrolló en tres fases. La primera fase analizó las herramientas actuales y las métricas de asignación de compensaciones por pérdida de biodiversidad basadas en análisis de atributos y servicios ecosistémicos. En la segunda fase se definieron los criterios y la fórmula de asignación de compensaciones mediante una métrica de área hábitat, a partir de la identificación de variables de paisaje, servicios ecosistémicos y atributos de estructura, función y composición. La tercera fase consistió en un análisis comparativo entre la métrica propuesta y la actual metodología de asignación de compensaciones en Colombia para tres proyectos en etapa de licenciamiento (aprobados y pendientes de aprobación). Los resultados de la investigación evidenciaron que la implementación de la metodología propuesta proporciona un aumento en las áreas a compensar en ecosistemas naturales y transformados en comparación con la métrica actual, debido principalmente a la inclusión de variables asociadas al reconocimiento de los atributos y del criterio de servicios ecosistémicos que permitió definir un factor de compensación más detallado. La metodología de asignación de compensaciones propuesta permitiría a los desarrolladores de proyectos compensar sus impactos residuales de manera más acertada ya que ofrece un análisis más detallado de las características de los atributos y servicios de los ecosistemas donde se identificaron los impactos residuales, además de aportar a las autoridades ambientales elementos asociados con indicadores de evaluación de pérdidas y ganancias netas en biodiversidad, con resultados efectivos que demuestren el cumplimiento de la ganancia neta en biodiversidad.