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Biblos-e Archivo
Bachelor thesis . 2021
Data sources: Biblos-e Archivo
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Simulación de modelos evolutivos en cáncer: nuevos modelos de crecimiento

Authors: González Klein, Alberto;

Simulación de modelos evolutivos en cáncer: nuevos modelos de crecimiento

Abstract

El cáncer actualmente es una de las enfermedades más mortales del mundo. Sin embargo, gracias al avance de la tecnología, se ha mejorado su detección y tratamiento. Una herramienta para ayudar a la detección del cáncer es el paquete OncoSimulR de R, el cual permite realizar simulaciones de crecimiento tumoral utilizando algoritmos matemáticos. El usuario puede especificar diversos modos de interacciones entre tipos de células, como relaciones de orden o epistasia, e incluso introducir explícitamente las tasas de nacimiento de las células. En este trabajo se va a incorporar nueva funcionalidad a este paquete, permitiendo a los usuarios especificar tasas de muerte de los distintos genotipos que se especifiquen, así como mantener la población total aproximadamente constante. De esta forma se mejorará la usabilidad y la flexibilidad del paquete, permitiendo a los usuarios utilizar modelos de crecimiento prácticamente arbitrarios. Además, se realizará una revisión de los algoritmos existentes que permitan simular procesos estocásticos, destacando sus diferencias. Una vez incorporada la nueva funcionalidad, se comprobará su correcto funcionamiento. Para ello se desarrollará una batería de tests que compruebe la salida de las funciones en todos los posibles casos, además de los errores que se deben detectar para garantizar su correcto funcionamiento. Esta es unatarea fundamental a la par que complicada, ya que no se conoce completamente el resultado de los tests debido a la estocasticidad. Por tanto, se deben identificar casos clave que nos indiquen que el funcionamiento es correcto. Además de los nuevos tests incoporados, se utilizarán tests previamente presentes en el paquete para garantizar que la incoporación de la nueva funcionalidad no cause errores en otras partes del paquete. Posteriormente, se propocionará un conjunto de resultados y ejemplos en los que utilizar la funcionalidad desarrollada. Por último, se expondrán las conclusiones obtenidas a lo largo de la elaboración de este trabajo, así como posibles líneas de trabajo futuro.

Country
Spain
Related Organizations
Keywords

Informática, Cáncer, Simulación, Genotipo

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