Dado que la permanencia de las plantaciones de manzano en el mismo lugar dura más de quince años, la relación que se establece entre las poblaciones de las plagas y las de sus enemigos naturales pueden ser más estables a lo largo del tiempo. Por este motivo, el control biológico de conservación es especialmente importante. La fauna de enemigos naturales que sepueden encontrar de forma natural en las plantaciones de manzano es capaz de controlar las poblaciones de algunas plagas, como la araña roja de los frutales o las orugas minadoras de hojas. En otros casos, como el piojo de San José o el pulgón verde, son un componente importante de su control, aunque no siempre su eficacia es suficientemente grande.