Anaplasma phagocytophilum je pôvodcom granulocytárnej anaplazmózy ľudí a zvierat. V Európe je prenášaná kliešťami z rodu Ixodes a to ajmä druhom Ixodes ricinus. Rezervoárovými hostiteľmi sú viaceré druhy stavovcov, ktoré sú špecificky viazané na určité genotypy tejto vnútrobunkovej baktérie. Vzhľadom na väčšiu genetickú heterogenitu A. phagocytophilum v Európe je jej ekologická asociácia s rezervoárovými hostiteľmi nie úplne objasnená. Na lepšie pochopenie potenciálneho risku prenosu A. phagocytophilum na ľudí a domáce zvieratá je potrebné objasniť cirkuláciu rôznych genotypov tejto baktérie a jej asociáciu s rôznymi rezervoárovými hostiteľmi. Našim cieľom bolo určiť vnútrodruhovú variabilitu kmeňov A. phagocytophilum cirkulujúcich v severnom Taliansku (provincia Trentino) u kliešťov cicajúcich na širokom spektre hostiteľov ako napríklad na psoch, ovciach, vtákoch, hlodavcoch, vysokej lesnej zvery a tiež kliešťoch cicajúcich na ľuďoch. Celkom 821 kliešťov I. ricinus z vegetácie, 284 kliešťov cicajúcich Bunkový metabolizmus, fyziológia, molekulárna biológia a genetika 13 na rôznych hostiteľoch (psy, ovce, vtáky, hlodavce, vysoká lesná zver, ľudia) a 1295 vzoriek krvi z hlodavcov bolo pomocou PCR a Real-time PCR analyzovaných na prítomnosť baktérie A. phagocytophilum. Vnútrodruhová variabilita a fylogenetické stromy boli zostrojené pomocou analýzy sekvencii (msp4, groEL) z pozitívnych kliešťov z vegetácie, z pozitívnych kliešťov z hostiteľov a krvných vzoriek z hlodavcov. Následne fylogenetické stromy poukázali na dve hlavne skupiny genotypov A. phagocytophilum cirkulujúcich v severnom Taliansku. Prvá skupina pozostávala z kmeňov nájdených u vysokej lesnej zvery, oviec, psov, ľudí a kmeňov nájdených u kliešťov z vegetácie a druhá skupina genotypov pozostávala len z kmeňov nájdených v krvných vzorkách u hlodavcov. Tieto genotypy z hlodavcov boli identické s genotypmi nájdenými u kliešťov I. trianguliceps na Slovensku a UK [1]. Naša štúdia sa prikláňa k hypotéze o existencii dvoch separovaných enzootických cykloch A. phagocytophilum cirkulujúcich v Európe a taktiež objasňuje pôvod kmeňov ohrozujúcich ľudí ako aj domáce zvieratá