O sistema imunitário é constituído por um conjunto de células com capacidade de se diferenciar, convertendo estímulos externos em complexas redes regulatórias intracelulares. Os linfócitos T CD4+ podem diferenciar se em células efetoras (Teff), entre as quais as células Th1 e Th17, que produzem as citocinas pró inflamatórias interferão γ e interleucina 17, respetivamente e em células reguladoras (Treg), que funcionam como inibidoras da ação de células Teff. Se o balanço entre as células Teff e Treg ficar comprometido, haverá um desequilíbrio na resposta imunitária que pode desencadear autoimunidade. Assim, o estudo dos mecanismos moleculares envolvidos na diferenciação destas células poderá ser crítico na prevenção da autoimunidade. Os microRNAs são RNAs não codificantes que atuam como reguladores negativos da expressão da maioria dos genes, estando envolvidos na regulação da diferenciação de células Th1, Th17 e Treg. Neste trabalho de revisão de literatura foi feita uma pesquisa sobre o perfil de expressão de microRNAs em doenças autoimunes. Foram identificados microRNAs funcionalmente importantes na regulação da expressão de genes envolvidos na diferenciação de Th1, Th17 e Treg no lúpus eritematoso sistémico, artrite reumatóide, psoríase, doença de Crohn e esclerose múltipla em modelos animais e em amostras humanas, tendo se observado que alguns miRNAs se encontram desregulados em várias doenças autoimunes. Foi também analisada a expressão dos microRNAs selecionados num modelo experimental de esclerose múltipla, tendo se identificado seis diferencialmente expressos. Conclui se que os microRNAs constituem fatores reguladores cruciais na diferenciação das células T CD4+ que poderão ser usados como potenciais biomarcadores ou como alvos terapêuticos de doenças autoimunes.