Este estudo foi levado a cabo entre Abril de 2008 e Março de 2010, com o objectivo de determinar a prevalência de parasitas gastrointestinais em cães sem sinais clínicos (n = 175) ou com suspeita de doença do foro digestivo (n = 193), que deram entrada no Hospital Veterinário do Porto. A prevalência de parasitas intestinais foi de 21% nos cães clinicamente sãos. Cystoisospora canis foi o protozoário mais prevalente (8,0%) seguido de Giardia spp.(7,4%). Toxocara canis (5,1%) foi o helminte mais frequente, seguido de Trichuris vulpis (1,1%) e Toxascaris leonina (0,6%). A prevalência de infecção foi maior nos cachorros (≤ 6 meses) (29%) do que nos adultos (> 12 meses) (11%), sendo a diferença significativa. Verificaram-se igualmente diferenças significativas na prevalência entre cachorros (14%) e adultos (1%) relativamente à infecção por Cystoisospora. Na infecção por Toxocara canis observou-se diferença significativa entre machos (2%) e fêmeas (9%). No grupo dos suspeitos foram encontrados parasitas em 34% dos cães, constatando-se que Giardia spp.(15,5%) foi o parasita mais frequente seguido de Cystoisospora canis (13,5%). Ainda neste grupo encontrou-se também T. canis (7,8%), T. vulpis (2,6%) e T. leonina (0,5%). Foram detectadas diferenças estatisticamente significativas quanto à percentagem de infecção entre cachorros (55%) e jovens (> 6 meses e ≤ 1 ano) (21%) e entre cachorros e adultos (15%). Relativamente à infecção por Giardia, foram observadas diferenças significativas entre cachorros (23%) e adultos (9%) clinicamente suspeitos, assim como entre cachorros (29%) e as outras duas faixas etárias, jovens (0%) e adultos (1%), quanto à infecção por Cystoisospora. Verificou-se diferença significativa na frequência de dor abdominal entre animais suspeitos infectados (19%) e suspeitos não infectados (7%). Relativamente ao vómito observou-se diferença estatisticamente significativa entre cães clinicamente suspeitos e infectados (3%) por Giardia spp. e suspeitos não infectados (31%) pelo protozoário. Protozoários e helmintes são agentes patogénicos prevalentes nos cães, nos quais constituem uma das principais causas de doença gastrintestinal.