El liquen plano oral (LPO) afecta a aproximadamente al 1% de la población mundial y se considera un trastorno oral potencialmente maligno (TOPM). Sin embargo, cuando se valoran los criterios histopatológicos se denota una controversia entre los investigadores, especialmente en relación a la presencia de displasia epitelial como criterio diagnóstico de exclusión para el LPO. Muchos patólogos consideran actualmente la presencia de displasia epitelial como un criterio de exclusión. En este estudio, se examinaron los perfiles moleculares de la displasia epitelial oral con características liquenoides (OLD), LPO y DEO para determinar si OLD representa una entidad separada. Se utilizaron muestras parafinadas para el análisis proteómico con LC-MS/MS y posteriormente el SWATH-MS para la identificación y cuantificación de proteínas. Se analizaron y perfilaron los proteomas de tejido de los tres grupos. Se identificaron un total de 366 proteínas. Se realizaron tres comparaciones: DEO frente LPO, OLD frente DEO y DEO frente OLD. El análisis de expresión diferencial reveló siete proteínas con diferencias significativas (p<0.05) en DEO en comparación con LPO. En la segunda comparación se identificaron 15 proteínas, y en la tercera se identificaron 12 proteínas. Los resultados del análisis proteómico revelaron que OLD no es una entidad patológica distinta, aunque se asemeja mucho a DEO. Sin embargo, se destacó que la displasia epitelial no debe considerarse un criterio de exclusión para el LPO desde una perspectiva proteómica. Además, se observó una alta expresión de genes relacionados con funciones biológicas en OLD y DEO, y baja expresión en LPO. El enriquecimiento funcional reveló vías y ontologías significativas relacionadas con la señalización inflamatoria y la respuesta inmunológica en todos los subgrupos. En conclusión, los datos proteómicos obtenidos en este estudio indican que OLD no representa una entidad patológica independiente, aunque se encuentra estrechamente relacionada con DEO. Asimismo, se resalta la importancia de reconsiderar la presencia de displasia epitelial como criterio de exclusión para el diagnóstico de LPO desde una perspectiva proteómica