Introducción: Las enfermedades genéticas constituyen una parte notable de la patología pediátrica. El cribado neonatal es un programa de salud pública cuyo objetivo es identificar a los recién nacidos presintomáticos con trastornos en los que un tratamiento precoz evitaría el desarrollo de daños graves e irreversibles. El rápido avance de las técnicas de secuenciación masiva ha supuesto una revolución a nivel médico, planteándose su implementación en el cribado metabólico actual. Sin embargo, la decisión de adoptar un programa de este tipo debe abordar previamente el análisis de varias consideraciones. Objetivos: Obtener la evidencia disponible hasta la fecha acerca de los aspectos técnicos, éticos y sociales de la implementación del cribado genético neonatal como prueba de primer nivel. Material y métodos: Esta revisión resume la evidencia disponible sobre el empleo de diferentes métodos de NGS en un entorno de cribado neonatal. Para ello, se realizó una búsqueda en diferentes bases de datos siguiendo la declaración PRISMA, estableciéndose previamente criterios de inclusión y exclusión utilizando el sistema PICOs. Resultados: Finalmente fueron incluidos 7 estudios, que emplearon WES, WGS o paneles genéticos como método de secuenciación. En general, demostraron una reducción de la sensibilidad respecto al cribado neonatal convencional, así como la identificación de una gran cantidad de hallazgos secundarios. Discusión: La cantidad de información generada mostró hallazgos incidentales y variantes relacionadas con el estado de portador, que suponen un desafío en cuanto a su interpretación y divulgación al no demostrar utilidad clínica inmediata; pudiendo suscitar estrés familiar y una sobrecarga en el circuito asistencial, requiriendo además el desarrollo de protocolos de seguimiento adecuados en el caso de la identificación de variantes de significado incierto. Conclusiones: La NGS no debería reemplaza al cribado metabólico actual, pudiendo resultar de utilidad como método complementario; y es necesario el desarrollo de estudios futuros para investigar más en detalle los factores técnicos, éticos y psicosociales asociados al cribado genético